Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVH0

Tvp23a, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tvp23aQ6NVH0 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tvp23aQ6NVH0 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tvp23aQ6NVH0 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tvp23aQ6NVH0 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tvp23aQ6NVH0 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tvp23aQ6NVH0 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tvp23aQ6NVH0 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tvp23aQ6NVH0 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Tvp23aQ6NVH0 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tvp23aQ6NVH0 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tvp23aQ6NVH0 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tvp23aQ6NVH0 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tvp23aQ6NVH0 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tvp23aQ6NVH0 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tvp23aQ6NVH0 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tvp23aQ6NVH0 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tvp23aQ6NVH0 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tvp23aQ6NVH0 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tvp23aQ6NVH0 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tvp23aQ6NVH0 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tvp23aQ6NVH0 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Tvp23aQ6NVH0 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tvp23aQ6NVH0 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tvp23aQ6NVH0 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Tvp23aQ6NVH0 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tvp23aQ6NVH0 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tvp23aQ6NVH0 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tvp23aQ6NVH0 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tvp23aQ6NVH0 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tvp23aQ6NVH0 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tvp23aQ6NVH0 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tvp23aQ6NVH0 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Tvp23aQ6NVH0 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tvp23aQ6NVH0 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tvp23aQ6NVH0 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tvp23aQ6NVH0 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tvp23aQ6NVH0 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Tvp23aQ6NVH0 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Tvp23aQ6NVH0 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Tvp23aQ6NVH0 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tvp23aQ6NVH0 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tvp23aQ6NVH0 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tvp23aQ6NVH0 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tvp23aQ6NVH0 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tvp23aQ6NVH0 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tvp23aQ6NVH0 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tvp23aQ6NVH0 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tvp23aQ6NVH0 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tvp23aQ6NVH0 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tvp23aQ6NVH0 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tvp23aQ6NVH0 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tvp23aQ6NVH0 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tvp23aQ6NVH0 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tvp23aQ6NVH0 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tvp23aQ6NVH0 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tvp23aQ6NVH0 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tvp23aQ6NVH0 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Tvp23aQ6NVH0 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tvp23aQ6NVH0 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tvp23aQ6NVH0 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tvp23aQ6NVH0 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tvp23aQ6NVH0 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tvp23aQ6NVH0 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tvp23aQ6NVH0 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tvp23aQ6NVH0 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tvp23aQ6NVH0 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tvp23aQ6NVH0 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tvp23aQ6NVH0 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tvp23aQ6NVH0 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tvp23aQ6NVH0 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Tvp23aQ6NVH0 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tvp23aQ6NVH0 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tvp23aQ6NVH0 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tvp23aQ6NVH0 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tvp23aQ6NVH0 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tvp23aQ6NVH0 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tvp23aQ6NVH0 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Tvp23aQ6NVH0 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tvp23aQ6NVH0 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tvp23aQ6NVH0 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tvp23aQ6NVH0 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tvp23aQ6NVH0 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tvp23aQ6NVH0 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Tvp23aQ6NVH0 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tvp23aQ6NVH0 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tvp23aQ6NVH0 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Tvp23aQ6NVH0 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tvp23aQ6NVH0 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tvp23aQ6NVH0 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tvp23aQ6NVH0 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tvp23aQ6NVH0 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tvp23aQ6NVH0 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tvp23aQ6NVH0 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tvp23aQ6NVH0 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tvp23aQ6NVH0 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tvp23aQ6NVH0 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tvp23aQ6NVH0 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tvp23aQ6NVH0 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tvp23aQ6NVH0 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tvp23aQ6NVH0 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms