Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU5

Cltb, Clathrin light chain B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltbQ6IRU5 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CltbQ6IRU5 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CltbQ6IRU5 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CltbQ6IRU5 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CltbQ6IRU5 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CltbQ6IRU5 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CltbQ6IRU5 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CltbQ6IRU5 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CltbQ6IRU5 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CltbQ6IRU5 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CltbQ6IRU5 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CltbQ6IRU5 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CltbQ6IRU5 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CltbQ6IRU5 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CltbQ6IRU5 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CltbQ6IRU5 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CltbQ6IRU5 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CltbQ6IRU5 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CltbQ6IRU5 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CltbQ6IRU5 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CltbQ6IRU5 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CltbQ6IRU5 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CltbQ6IRU5 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CltbQ6IRU5 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CltbQ6IRU5 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CltbQ6IRU5 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CltbQ6IRU5 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CltbQ6IRU5 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CltbQ6IRU5 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CltbQ6IRU5 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CltbQ6IRU5 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CltbQ6IRU5 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CltbQ6IRU5 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CltbQ6IRU5 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CltbQ6IRU5 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CltbQ6IRU5 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CltbQ6IRU5 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CltbQ6IRU5 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CltbQ6IRU5 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CltbQ6IRU5 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CltbQ6IRU5 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CltbQ6IRU5 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CltbQ6IRU5 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CltbQ6IRU5 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CltbQ6IRU5 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CltbQ6IRU5 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CltbQ6IRU5 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CltbQ6IRU5 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CltbQ6IRU5 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CltbQ6IRU5 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CltbQ6IRU5 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CltbQ6IRU5 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CltbQ6IRU5 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CltbQ6IRU5 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CltbQ6IRU5 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CltbQ6IRU5 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CltbQ6IRU5 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CltbQ6IRU5 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CltbQ6IRU5 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CltbQ6IRU5 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CltbQ6IRU5 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CltbQ6IRU5 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CltbQ6IRU5 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CltbQ6IRU5 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CltbQ6IRU5 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CltbQ6IRU5 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CltbQ6IRU5 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CltbQ6IRU5 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CltbQ6IRU5 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CltbQ6IRU5 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CltbQ6IRU5 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CltbQ6IRU5 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CltbQ6IRU5 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CltbQ6IRU5 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CltbQ6IRU5 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CltbQ6IRU5 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CltbQ6IRU5 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CltbQ6IRU5 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CltbQ6IRU5 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CltbQ6IRU5 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CltbQ6IRU5 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CltbQ6IRU5 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CltbQ6IRU5 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CltbQ6IRU5 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CltbQ6IRU5 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CltbQ6IRU5 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CltbQ6IRU5 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CltbQ6IRU5 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CltbQ6IRU5 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CltbQ6IRU5 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CltbQ6IRU5 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CltbQ6IRU5 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CltbQ6IRU5 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CltbQ6IRU5 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CltbQ6IRU5 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CltbQ6IRU5 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CltbQ6IRU5 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CltbQ6IRU5 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CltbQ6IRU5 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CltbQ6IRU5 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms