Protein–RNA interactions for Protein: Q6IR41

C1qtnf6, Complement C1q tumor necrosis factor-related protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1qtnf6Q6IR41 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
C1qtnf6Q6IR41 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
C1qtnf6Q6IR41 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
C1qtnf6Q6IR41 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
C1qtnf6Q6IR41 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
C1qtnf6Q6IR41 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
C1qtnf6Q6IR41 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
C1qtnf6Q6IR41 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
C1qtnf6Q6IR41 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
C1qtnf6Q6IR41 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
C1qtnf6Q6IR41 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
C1qtnf6Q6IR41 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
C1qtnf6Q6IR41 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
C1qtnf6Q6IR41 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
C1qtnf6Q6IR41 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
C1qtnf6Q6IR41 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
C1qtnf6Q6IR41 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
C1qtnf6Q6IR41 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
C1qtnf6Q6IR41 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C1qtnf6Q6IR41 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C1qtnf6Q6IR41 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C1qtnf6Q6IR41 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C1qtnf6Q6IR41 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C1qtnf6Q6IR41 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C1qtnf6Q6IR41 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C1qtnf6Q6IR41 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C1qtnf6Q6IR41 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C1qtnf6Q6IR41 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C1qtnf6Q6IR41 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C1qtnf6Q6IR41 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
C1qtnf6Q6IR41 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C1qtnf6Q6IR41 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C1qtnf6Q6IR41 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C1qtnf6Q6IR41 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
C1qtnf6Q6IR41 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C1qtnf6Q6IR41 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C1qtnf6Q6IR41 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
C1qtnf6Q6IR41 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C1qtnf6Q6IR41 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C1qtnf6Q6IR41 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C1qtnf6Q6IR41 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
C1qtnf6Q6IR41 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C1qtnf6Q6IR41 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
C1qtnf6Q6IR41 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
C1qtnf6Q6IR41 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C1qtnf6Q6IR41 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
C1qtnf6Q6IR41 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C1qtnf6Q6IR41 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
C1qtnf6Q6IR41 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C1qtnf6Q6IR41 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C1qtnf6Q6IR41 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
C1qtnf6Q6IR41 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
C1qtnf6Q6IR41 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
C1qtnf6Q6IR41 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C1qtnf6Q6IR41 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
C1qtnf6Q6IR41 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C1qtnf6Q6IR41 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C1qtnf6Q6IR41 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C1qtnf6Q6IR41 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C1qtnf6Q6IR41 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
C1qtnf6Q6IR41 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C1qtnf6Q6IR41 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C1qtnf6Q6IR41 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
C1qtnf6Q6IR41 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
C1qtnf6Q6IR41 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
C1qtnf6Q6IR41 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
C1qtnf6Q6IR41 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
C1qtnf6Q6IR41 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
C1qtnf6Q6IR41 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
C1qtnf6Q6IR41 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
C1qtnf6Q6IR41 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
C1qtnf6Q6IR41 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
C1qtnf6Q6IR41 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
C1qtnf6Q6IR41 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
C1qtnf6Q6IR41 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
C1qtnf6Q6IR41 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
C1qtnf6Q6IR41 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
C1qtnf6Q6IR41 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
C1qtnf6Q6IR41 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C1qtnf6Q6IR41 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C1qtnf6Q6IR41 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C1qtnf6Q6IR41 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C1qtnf6Q6IR41 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C1qtnf6Q6IR41 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C1qtnf6Q6IR41 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C1qtnf6Q6IR41 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C1qtnf6Q6IR41 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C1qtnf6Q6IR41 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C1qtnf6Q6IR41 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C1qtnf6Q6IR41 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C1qtnf6Q6IR41 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C1qtnf6Q6IR41 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C1qtnf6Q6IR41 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C1qtnf6Q6IR41 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C1qtnf6Q6IR41 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C1qtnf6Q6IR41 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C1qtnf6Q6IR41 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C1qtnf6Q6IR41 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C1qtnf6Q6IR41 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C1qtnf6Q6IR41 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms