Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFT4

Arhgap20, Rho GTPase-activating protein 20, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap20Q6IFT4 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Arhgap20Q6IFT4 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Arhgap20Q6IFT4 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Arhgap20Q6IFT4 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Arhgap20Q6IFT4 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Arhgap20Q6IFT4 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Arhgap20Q6IFT4 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Arhgap20Q6IFT4 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Arhgap20Q6IFT4 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Arhgap20Q6IFT4 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Arhgap20Q6IFT4 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Arhgap20Q6IFT4 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Arhgap20Q6IFT4 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Arhgap20Q6IFT4 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Arhgap20Q6IFT4 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Arhgap20Q6IFT4 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Arhgap20Q6IFT4 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Arhgap20Q6IFT4 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Arhgap20Q6IFT4 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Arhgap20Q6IFT4 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Arhgap20Q6IFT4 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Arhgap20Q6IFT4 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Arhgap20Q6IFT4 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Arhgap20Q6IFT4 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Arhgap20Q6IFT4 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Arhgap20Q6IFT4 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Arhgap20Q6IFT4 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Arhgap20Q6IFT4 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Arhgap20Q6IFT4 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Arhgap20Q6IFT4 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Arhgap20Q6IFT4 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Arhgap20Q6IFT4 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Arhgap20Q6IFT4 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Arhgap20Q6IFT4 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Arhgap20Q6IFT4 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Arhgap20Q6IFT4 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Arhgap20Q6IFT4 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Arhgap20Q6IFT4 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Arhgap20Q6IFT4 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Arhgap20Q6IFT4 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Arhgap20Q6IFT4 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Arhgap20Q6IFT4 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Arhgap20Q6IFT4 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Arhgap20Q6IFT4 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Arhgap20Q6IFT4 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Arhgap20Q6IFT4 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Arhgap20Q6IFT4 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Arhgap20Q6IFT4 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Arhgap20Q6IFT4 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Arhgap20Q6IFT4 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Arhgap20Q6IFT4 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Arhgap20Q6IFT4 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Arhgap20Q6IFT4 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Arhgap20Q6IFT4 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Arhgap20Q6IFT4 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Arhgap20Q6IFT4 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Arhgap20Q6IFT4 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Arhgap20Q6IFT4 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Arhgap20Q6IFT4 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Arhgap20Q6IFT4 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Arhgap20Q6IFT4 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Arhgap20Q6IFT4 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Arhgap20Q6IFT4 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Arhgap20Q6IFT4 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Arhgap20Q6IFT4 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Arhgap20Q6IFT4 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Arhgap20Q6IFT4 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Arhgap20Q6IFT4 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Arhgap20Q6IFT4 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Arhgap20Q6IFT4 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Arhgap20Q6IFT4 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Arhgap20Q6IFT4 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Arhgap20Q6IFT4 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Arhgap20Q6IFT4 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Arhgap20Q6IFT4 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Arhgap20Q6IFT4 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Arhgap20Q6IFT4 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Arhgap20Q6IFT4 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Arhgap20Q6IFT4 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Arhgap20Q6IFT4 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Arhgap20Q6IFT4 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Arhgap20Q6IFT4 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Arhgap20Q6IFT4 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Arhgap20Q6IFT4 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Arhgap20Q6IFT4 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Arhgap20Q6IFT4 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Arhgap20Q6IFT4 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Arhgap20Q6IFT4 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Arhgap20Q6IFT4 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Arhgap20Q6IFT4 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Arhgap20Q6IFT4 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Arhgap20Q6IFT4 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Arhgap20Q6IFT4 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Arhgap20Q6IFT4 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Arhgap20Q6IFT4 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Arhgap20Q6IFT4 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Arhgap20Q6IFT4 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Arhgap20Q6IFT4 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Arhgap20Q6IFT4 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Arhgap20Q6IFT4 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms