Protein–RNA interactions for Protein: Q6IE21

Otud6a, OTU domain-containing protein 6A, mousemouse

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud6aQ6IE21 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Otud6aQ6IE21 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Otud6aQ6IE21 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Otud6aQ6IE21 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Otud6aQ6IE21 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Otud6aQ6IE21 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Otud6aQ6IE21 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Otud6aQ6IE21 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Otud6aQ6IE21 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Otud6aQ6IE21 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Otud6aQ6IE21 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Otud6aQ6IE21 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Otud6aQ6IE21 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Otud6aQ6IE21 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Otud6aQ6IE21 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Otud6aQ6IE21 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Otud6aQ6IE21 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Otud6aQ6IE21 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Otud6aQ6IE21 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Otud6aQ6IE21 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Otud6aQ6IE21 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Otud6aQ6IE21 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Otud6aQ6IE21 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Otud6aQ6IE21 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Otud6aQ6IE21 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Otud6aQ6IE21 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Otud6aQ6IE21 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Otud6aQ6IE21 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Otud6aQ6IE21 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Otud6aQ6IE21 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Otud6aQ6IE21 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Otud6aQ6IE21 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Otud6aQ6IE21 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Otud6aQ6IE21 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Otud6aQ6IE21 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Otud6aQ6IE21 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Otud6aQ6IE21 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Otud6aQ6IE21 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Otud6aQ6IE21 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Otud6aQ6IE21 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Otud6aQ6IE21 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Otud6aQ6IE21 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Otud6aQ6IE21 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Otud6aQ6IE21 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Otud6aQ6IE21 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Otud6aQ6IE21 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Otud6aQ6IE21 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Otud6aQ6IE21 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Otud6aQ6IE21 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Otud6aQ6IE21 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Otud6aQ6IE21 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Otud6aQ6IE21 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Otud6aQ6IE21 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Otud6aQ6IE21 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Otud6aQ6IE21 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Otud6aQ6IE21 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Otud6aQ6IE21 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Otud6aQ6IE21 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Otud6aQ6IE21 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Otud6aQ6IE21 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Otud6aQ6IE21 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Otud6aQ6IE21 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Otud6aQ6IE21 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Otud6aQ6IE21 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Otud6aQ6IE21 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Otud6aQ6IE21 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Otud6aQ6IE21 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Otud6aQ6IE21 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Otud6aQ6IE21 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Otud6aQ6IE21 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Otud6aQ6IE21 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Otud6aQ6IE21 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Otud6aQ6IE21 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Otud6aQ6IE21 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Otud6aQ6IE21 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Otud6aQ6IE21 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Otud6aQ6IE21 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Otud6aQ6IE21 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Otud6aQ6IE21 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Otud6aQ6IE21 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Otud6aQ6IE21 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Otud6aQ6IE21 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Otud6aQ6IE21 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Otud6aQ6IE21 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Otud6aQ6IE21 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Otud6aQ6IE21 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Otud6aQ6IE21 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Otud6aQ6IE21 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Otud6aQ6IE21 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Otud6aQ6IE21 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Otud6aQ6IE21 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Otud6aQ6IE21 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Otud6aQ6IE21 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Otud6aQ6IE21 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Otud6aQ6IE21 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Otud6aQ6IE21 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Otud6aQ6IE21 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Otud6aQ6IE21 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Otud6aQ6IE21 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Otud6aQ6IE21 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms