Protein–RNA interactions for Protein: Q6EDY6

Carmil1, F-actin-uncapping protein LRRC16A, mousemouse

Predictions only

Length 1,374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carmil1Q6EDY6 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Carmil1Q6EDY6 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Carmil1Q6EDY6 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Carmil1Q6EDY6 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Carmil1Q6EDY6 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Carmil1Q6EDY6 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Carmil1Q6EDY6 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Carmil1Q6EDY6 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Carmil1Q6EDY6 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Carmil1Q6EDY6 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Carmil1Q6EDY6 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Carmil1Q6EDY6 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Carmil1Q6EDY6 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Carmil1Q6EDY6 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Carmil1Q6EDY6 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Carmil1Q6EDY6 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Carmil1Q6EDY6 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Carmil1Q6EDY6 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Carmil1Q6EDY6 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Carmil1Q6EDY6 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Carmil1Q6EDY6 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Carmil1Q6EDY6 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Carmil1Q6EDY6 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Carmil1Q6EDY6 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Carmil1Q6EDY6 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Carmil1Q6EDY6 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Carmil1Q6EDY6 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Carmil1Q6EDY6 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Carmil1Q6EDY6 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Carmil1Q6EDY6 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Carmil1Q6EDY6 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Carmil1Q6EDY6 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Carmil1Q6EDY6 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Carmil1Q6EDY6 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Carmil1Q6EDY6 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Carmil1Q6EDY6 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Carmil1Q6EDY6 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Carmil1Q6EDY6 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Carmil1Q6EDY6 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Carmil1Q6EDY6 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Carmil1Q6EDY6 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Carmil1Q6EDY6 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Carmil1Q6EDY6 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Carmil1Q6EDY6 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Carmil1Q6EDY6 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Carmil1Q6EDY6 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Carmil1Q6EDY6 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Carmil1Q6EDY6 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Carmil1Q6EDY6 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Carmil1Q6EDY6 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Carmil1Q6EDY6 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Carmil1Q6EDY6 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Carmil1Q6EDY6 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Carmil1Q6EDY6 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Carmil1Q6EDY6 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Carmil1Q6EDY6 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Carmil1Q6EDY6 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Carmil1Q6EDY6 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Carmil1Q6EDY6 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Carmil1Q6EDY6 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Carmil1Q6EDY6 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Carmil1Q6EDY6 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Carmil1Q6EDY6 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Carmil1Q6EDY6 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Carmil1Q6EDY6 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Carmil1Q6EDY6 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Carmil1Q6EDY6 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Carmil1Q6EDY6 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Carmil1Q6EDY6 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Carmil1Q6EDY6 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Carmil1Q6EDY6 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Carmil1Q6EDY6 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Carmil1Q6EDY6 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Carmil1Q6EDY6 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Carmil1Q6EDY6 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Carmil1Q6EDY6 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Carmil1Q6EDY6 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Carmil1Q6EDY6 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Carmil1Q6EDY6 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Carmil1Q6EDY6 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Carmil1Q6EDY6 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Carmil1Q6EDY6 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Carmil1Q6EDY6 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Carmil1Q6EDY6 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Carmil1Q6EDY6 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Carmil1Q6EDY6 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Carmil1Q6EDY6 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Carmil1Q6EDY6 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Carmil1Q6EDY6 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Carmil1Q6EDY6 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Carmil1Q6EDY6 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Carmil1Q6EDY6 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Carmil1Q6EDY6 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Carmil1Q6EDY6 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Carmil1Q6EDY6 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Carmil1Q6EDY6 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Carmil1Q6EDY6 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Carmil1Q6EDY6 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Carmil1Q6EDY6 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Carmil1Q6EDY6 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms