Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFZ1

Gbf1, Golgi-specific brefeldin A-resistance factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbf1Q6DFZ1 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gbf1Q6DFZ1 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gbf1Q6DFZ1 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gbf1Q6DFZ1 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Gbf1Q6DFZ1 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gbf1Q6DFZ1 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gbf1Q6DFZ1 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gbf1Q6DFZ1 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gbf1Q6DFZ1 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gbf1Q6DFZ1 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gbf1Q6DFZ1 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gbf1Q6DFZ1 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gbf1Q6DFZ1 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gbf1Q6DFZ1 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gbf1Q6DFZ1 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gbf1Q6DFZ1 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gbf1Q6DFZ1 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gbf1Q6DFZ1 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gbf1Q6DFZ1 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Gbf1Q6DFZ1 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gbf1Q6DFZ1 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gbf1Q6DFZ1 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gbf1Q6DFZ1 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gbf1Q6DFZ1 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gbf1Q6DFZ1 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gbf1Q6DFZ1 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gbf1Q6DFZ1 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gbf1Q6DFZ1 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gbf1Q6DFZ1 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gbf1Q6DFZ1 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gbf1Q6DFZ1 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gbf1Q6DFZ1 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gbf1Q6DFZ1 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gbf1Q6DFZ1 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gbf1Q6DFZ1 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gbf1Q6DFZ1 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gbf1Q6DFZ1 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gbf1Q6DFZ1 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gbf1Q6DFZ1 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gbf1Q6DFZ1 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gbf1Q6DFZ1 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Gbf1Q6DFZ1 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gbf1Q6DFZ1 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gbf1Q6DFZ1 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gbf1Q6DFZ1 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gbf1Q6DFZ1 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gbf1Q6DFZ1 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gbf1Q6DFZ1 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gbf1Q6DFZ1 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gbf1Q6DFZ1 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gbf1Q6DFZ1 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gbf1Q6DFZ1 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gbf1Q6DFZ1 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gbf1Q6DFZ1 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gbf1Q6DFZ1 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gbf1Q6DFZ1 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Gbf1Q6DFZ1 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
Gbf1Q6DFZ1 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gbf1Q6DFZ1 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gbf1Q6DFZ1 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gbf1Q6DFZ1 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gbf1Q6DFZ1 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gbf1Q6DFZ1 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gbf1Q6DFZ1 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Gbf1Q6DFZ1 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gbf1Q6DFZ1 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gbf1Q6DFZ1 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gbf1Q6DFZ1 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gbf1Q6DFZ1 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gbf1Q6DFZ1 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gbf1Q6DFZ1 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gbf1Q6DFZ1 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gbf1Q6DFZ1 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gbf1Q6DFZ1 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gbf1Q6DFZ1 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gbf1Q6DFZ1 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gbf1Q6DFZ1 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gbf1Q6DFZ1 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gbf1Q6DFZ1 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gbf1Q6DFZ1 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gbf1Q6DFZ1 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gbf1Q6DFZ1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gbf1Q6DFZ1 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gbf1Q6DFZ1 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gbf1Q6DFZ1 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gbf1Q6DFZ1 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gbf1Q6DFZ1 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gbf1Q6DFZ1 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gbf1Q6DFZ1 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gbf1Q6DFZ1 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gbf1Q6DFZ1 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gbf1Q6DFZ1 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gbf1Q6DFZ1 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gbf1Q6DFZ1 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Gbf1Q6DFZ1 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gbf1Q6DFZ1 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gbf1Q6DFZ1 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gbf1Q6DFZ1 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gbf1Q6DFZ1 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gbf1Q6DFZ1 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms