Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW0

Guanine nucleotide exchange C9orf72 homolog, mousemouse

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Length 481 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6DFW0 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Q6DFW0 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Q6DFW0 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Q6DFW0 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Q6DFW0 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Q6DFW0 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Q6DFW0 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Q6DFW0 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Q6DFW0 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Q6DFW0 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Q6DFW0 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Q6DFW0 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Q6DFW0 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Q6DFW0 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Q6DFW0 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Q6DFW0 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q6DFW0 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q6DFW0 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q6DFW0 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q6DFW0 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q6DFW0 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q6DFW0 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q6DFW0 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Q6DFW0 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q6DFW0 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q6DFW0 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q6DFW0 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q6DFW0 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q6DFW0 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q6DFW0 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q6DFW0 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q6DFW0 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q6DFW0 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Q6DFW0 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q6DFW0 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q6DFW0 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q6DFW0 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q6DFW0 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q6DFW0 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q6DFW0 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q6DFW0 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q6DFW0 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q6DFW0 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q6DFW0 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Q6DFW0 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q6DFW0 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q6DFW0 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q6DFW0 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q6DFW0 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q6DFW0 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q6DFW0 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q6DFW0 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q6DFW0 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q6DFW0 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q6DFW0 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q6DFW0 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q6DFW0 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q6DFW0 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q6DFW0 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q6DFW0 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q6DFW0 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q6DFW0 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q6DFW0 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q6DFW0 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q6DFW0 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q6DFW0 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q6DFW0 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q6DFW0 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q6DFW0 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Q6DFW0 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q6DFW0 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q6DFW0 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q6DFW0 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q6DFW0 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q6DFW0 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q6DFW0 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q6DFW0 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q6DFW0 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q6DFW0 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q6DFW0 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q6DFW0 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q6DFW0 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q6DFW0 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q6DFW0 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q6DFW0 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q6DFW0 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q6DFW0 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q6DFW0 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q6DFW0 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q6DFW0 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q6DFW0 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q6DFW0 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q6DFW0 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Q6DFW0 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q6DFW0 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q6DFW0 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q6DFW0 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q6DFW0 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q6DFW0 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q6DFW0 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms