Protein–RNA interactions for Protein: Q6A0D4

Rftn1, Raftlin, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rftn1Q6A0D4 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rftn1Q6A0D4 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rftn1Q6A0D4 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rftn1Q6A0D4 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rftn1Q6A0D4 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rftn1Q6A0D4 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rftn1Q6A0D4 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rftn1Q6A0D4 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rftn1Q6A0D4 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rftn1Q6A0D4 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rftn1Q6A0D4 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rftn1Q6A0D4 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rftn1Q6A0D4 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rftn1Q6A0D4 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rftn1Q6A0D4 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rftn1Q6A0D4 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rftn1Q6A0D4 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Rftn1Q6A0D4 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rftn1Q6A0D4 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rftn1Q6A0D4 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rftn1Q6A0D4 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rftn1Q6A0D4 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rftn1Q6A0D4 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rftn1Q6A0D4 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rftn1Q6A0D4 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rftn1Q6A0D4 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rftn1Q6A0D4 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rftn1Q6A0D4 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rftn1Q6A0D4 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rftn1Q6A0D4 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rftn1Q6A0D4 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rftn1Q6A0D4 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rftn1Q6A0D4 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Rftn1Q6A0D4 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rftn1Q6A0D4 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Rftn1Q6A0D4 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Rftn1Q6A0D4 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rftn1Q6A0D4 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rftn1Q6A0D4 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rftn1Q6A0D4 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rftn1Q6A0D4 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rftn1Q6A0D4 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rftn1Q6A0D4 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rftn1Q6A0D4 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rftn1Q6A0D4 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rftn1Q6A0D4 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rftn1Q6A0D4 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rftn1Q6A0D4 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rftn1Q6A0D4 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rftn1Q6A0D4 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rftn1Q6A0D4 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rftn1Q6A0D4 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Rftn1Q6A0D4 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rftn1Q6A0D4 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rftn1Q6A0D4 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rftn1Q6A0D4 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rftn1Q6A0D4 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rftn1Q6A0D4 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Rftn1Q6A0D4 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rftn1Q6A0D4 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rftn1Q6A0D4 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rftn1Q6A0D4 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rftn1Q6A0D4 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Rftn1Q6A0D4 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rftn1Q6A0D4 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rftn1Q6A0D4 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rftn1Q6A0D4 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rftn1Q6A0D4 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rftn1Q6A0D4 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rftn1Q6A0D4 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rftn1Q6A0D4 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rftn1Q6A0D4 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rftn1Q6A0D4 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rftn1Q6A0D4 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rftn1Q6A0D4 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rftn1Q6A0D4 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rftn1Q6A0D4 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rftn1Q6A0D4 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rftn1Q6A0D4 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rftn1Q6A0D4 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rftn1Q6A0D4 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rftn1Q6A0D4 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rftn1Q6A0D4 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rftn1Q6A0D4 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rftn1Q6A0D4 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rftn1Q6A0D4 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rftn1Q6A0D4 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Rftn1Q6A0D4 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rftn1Q6A0D4 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rftn1Q6A0D4 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rftn1Q6A0D4 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rftn1Q6A0D4 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rftn1Q6A0D4 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rftn1Q6A0D4 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rftn1Q6A0D4 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rftn1Q6A0D4 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rftn1Q6A0D4 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rftn1Q6A0D4 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rftn1Q6A0D4 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rftn1Q6A0D4 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms