Protein–RNA interactions for Protein: Q6A065

Cep170, Centrosomal protein of 170 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep170Q6A065 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Cep170Q6A065 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cep170Q6A065 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cep170Q6A065 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cep170Q6A065 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cep170Q6A065 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cep170Q6A065 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cep170Q6A065 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cep170Q6A065 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cep170Q6A065 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cep170Q6A065 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cep170Q6A065 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cep170Q6A065 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cep170Q6A065 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cep170Q6A065 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cep170Q6A065 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Cep170Q6A065 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cep170Q6A065 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cep170Q6A065 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cep170Q6A065 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Cep170Q6A065 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Cep170Q6A065 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cep170Q6A065 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cep170Q6A065 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cep170Q6A065 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cep170Q6A065 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cep170Q6A065 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cep170Q6A065 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cep170Q6A065 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cep170Q6A065 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cep170Q6A065 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cep170Q6A065 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Cep170Q6A065 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cep170Q6A065 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cep170Q6A065 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cep170Q6A065 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cep170Q6A065 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cep170Q6A065 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Cep170Q6A065 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cep170Q6A065 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cep170Q6A065 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cep170Q6A065 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cep170Q6A065 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cep170Q6A065 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cep170Q6A065 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cep170Q6A065 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Cep170Q6A065 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Cep170Q6A065 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Cep170Q6A065 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Cep170Q6A065 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Cep170Q6A065 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cep170Q6A065 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cep170Q6A065 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cep170Q6A065 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cep170Q6A065 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cep170Q6A065 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cep170Q6A065 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Cep170Q6A065 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Cep170Q6A065 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Cep170Q6A065 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Cep170Q6A065 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
Cep170Q6A065 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Cep170Q6A065 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Cep170Q6A065 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
Cep170Q6A065 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Cep170Q6A065 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Cep170Q6A065 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Cep170Q6A065 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Cep170Q6A065 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Cep170Q6A065 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Cep170Q6A065 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Cep170Q6A065 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Cep170Q6A065 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Cep170Q6A065 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Cep170Q6A065 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Cep170Q6A065 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Cep170Q6A065 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Cep170Q6A065 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Cep170Q6A065 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Cep170Q6A065 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Cep170Q6A065 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Cep170Q6A065 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Cep170Q6A065 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Cep170Q6A065 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Cep170Q6A065 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Cep170Q6A065 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Cep170Q6A065 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
Cep170Q6A065 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Cep170Q6A065 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Cep170Q6A065 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
Cep170Q6A065 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
Cep170Q6A065 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Cep170Q6A065 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Cep170Q6A065 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Cep170Q6A065 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Cep170Q6A065 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Cep170Q6A065 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Cep170Q6A065 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Cep170Q6A065 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Cep170Q6A065 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms