Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

Predictions only

Length 1,063 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn3Q69ZS0 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pdzrn3Q69ZS0 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pdzrn3Q69ZS0 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pdzrn3Q69ZS0 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pdzrn3Q69ZS0 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pdzrn3Q69ZS0 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pdzrn3Q69ZS0 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pdzrn3Q69ZS0 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pdzrn3Q69ZS0 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pdzrn3Q69ZS0 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pdzrn3Q69ZS0 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Pdzrn3Q69ZS0 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pdzrn3Q69ZS0 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pdzrn3Q69ZS0 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pdzrn3Q69ZS0 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pdzrn3Q69ZS0 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pdzrn3Q69ZS0 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pdzrn3Q69ZS0 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pdzrn3Q69ZS0 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pdzrn3Q69ZS0 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pdzrn3Q69ZS0 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Pdzrn3Q69ZS0 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pdzrn3Q69ZS0 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pdzrn3Q69ZS0 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pdzrn3Q69ZS0 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pdzrn3Q69ZS0 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pdzrn3Q69ZS0 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Pdzrn3Q69ZS0 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pdzrn3Q69ZS0 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pdzrn3Q69ZS0 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pdzrn3Q69ZS0 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pdzrn3Q69ZS0 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pdzrn3Q69ZS0 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pdzrn3Q69ZS0 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pdzrn3Q69ZS0 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pdzrn3Q69ZS0 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pdzrn3Q69ZS0 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pdzrn3Q69ZS0 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pdzrn3Q69ZS0 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Pdzrn3Q69ZS0 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pdzrn3Q69ZS0 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pdzrn3Q69ZS0 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pdzrn3Q69ZS0 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pdzrn3Q69ZS0 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pdzrn3Q69ZS0 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pdzrn3Q69ZS0 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pdzrn3Q69ZS0 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pdzrn3Q69ZS0 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Pdzrn3Q69ZS0 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pdzrn3Q69ZS0 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pdzrn3Q69ZS0 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Pdzrn3Q69ZS0 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pdzrn3Q69ZS0 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pdzrn3Q69ZS0 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pdzrn3Q69ZS0 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pdzrn3Q69ZS0 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pdzrn3Q69ZS0 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pdzrn3Q69ZS0 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pdzrn3Q69ZS0 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pdzrn3Q69ZS0 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pdzrn3Q69ZS0 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pdzrn3Q69ZS0 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pdzrn3Q69ZS0 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pdzrn3Q69ZS0 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pdzrn3Q69ZS0 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pdzrn3Q69ZS0 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pdzrn3Q69ZS0 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pdzrn3Q69ZS0 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pdzrn3Q69ZS0 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pdzrn3Q69ZS0 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pdzrn3Q69ZS0 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pdzrn3Q69ZS0 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pdzrn3Q69ZS0 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pdzrn3Q69ZS0 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pdzrn3Q69ZS0 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pdzrn3Q69ZS0 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pdzrn3Q69ZS0 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Pdzrn3Q69ZS0 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pdzrn3Q69ZS0 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pdzrn3Q69ZS0 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pdzrn3Q69ZS0 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Pdzrn3Q69ZS0 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pdzrn3Q69ZS0 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pdzrn3Q69ZS0 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pdzrn3Q69ZS0 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pdzrn3Q69ZS0 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pdzrn3Q69ZS0 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pdzrn3Q69ZS0 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pdzrn3Q69ZS0 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pdzrn3Q69ZS0 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pdzrn3Q69ZS0 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pdzrn3Q69ZS0 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Pdzrn3Q69ZS0 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pdzrn3Q69ZS0 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pdzrn3Q69ZS0 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pdzrn3Q69ZS0 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pdzrn3Q69ZS0 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Pdzrn3Q69ZS0 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Pdzrn3Q69ZS0 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pdzrn3Q69ZS0 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
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