Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZK6

Jmjd1c, Probable JmjC domain-containing histone demethylation protein 2C, mousemouse

Predictions only

Length 2,350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd1cQ69ZK6 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Jmjd1cQ69ZK6 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Jmjd1cQ69ZK6 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Jmjd1cQ69ZK6 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Jmjd1cQ69ZK6 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Jmjd1cQ69ZK6 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Jmjd1cQ69ZK6 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Jmjd1cQ69ZK6 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Jmjd1cQ69ZK6 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Jmjd1cQ69ZK6 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Jmjd1cQ69ZK6 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Jmjd1cQ69ZK6 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Jmjd1cQ69ZK6 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Jmjd1cQ69ZK6 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Jmjd1cQ69ZK6 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Jmjd1cQ69ZK6 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Jmjd1cQ69ZK6 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Jmjd1cQ69ZK6 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Jmjd1cQ69ZK6 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Jmjd1cQ69ZK6 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Jmjd1cQ69ZK6 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Jmjd1cQ69ZK6 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Jmjd1cQ69ZK6 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Jmjd1cQ69ZK6 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Jmjd1cQ69ZK6 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Jmjd1cQ69ZK6 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Jmjd1cQ69ZK6 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Jmjd1cQ69ZK6 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Jmjd1cQ69ZK6 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Jmjd1cQ69ZK6 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Jmjd1cQ69ZK6 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Jmjd1cQ69ZK6 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Jmjd1cQ69ZK6 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Jmjd1cQ69ZK6 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Jmjd1cQ69ZK6 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Jmjd1cQ69ZK6 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Jmjd1cQ69ZK6 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Jmjd1cQ69ZK6 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Jmjd1cQ69ZK6 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Jmjd1cQ69ZK6 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Jmjd1cQ69ZK6 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Jmjd1cQ69ZK6 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Jmjd1cQ69ZK6 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Jmjd1cQ69ZK6 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Jmjd1cQ69ZK6 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Jmjd1cQ69ZK6 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Jmjd1cQ69ZK6 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Jmjd1cQ69ZK6 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Jmjd1cQ69ZK6 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Jmjd1cQ69ZK6 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Jmjd1cQ69ZK6 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Jmjd1cQ69ZK6 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Jmjd1cQ69ZK6 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Jmjd1cQ69ZK6 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Jmjd1cQ69ZK6 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Jmjd1cQ69ZK6 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Jmjd1cQ69ZK6 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Jmjd1cQ69ZK6 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Jmjd1cQ69ZK6 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Jmjd1cQ69ZK6 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Jmjd1cQ69ZK6 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Jmjd1cQ69ZK6 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Jmjd1cQ69ZK6 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Jmjd1cQ69ZK6 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Jmjd1cQ69ZK6 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Jmjd1cQ69ZK6 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Jmjd1cQ69ZK6 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Jmjd1cQ69ZK6 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Jmjd1cQ69ZK6 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Jmjd1cQ69ZK6 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Jmjd1cQ69ZK6 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Jmjd1cQ69ZK6 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Jmjd1cQ69ZK6 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Jmjd1cQ69ZK6 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Jmjd1cQ69ZK6 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Jmjd1cQ69ZK6 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Jmjd1cQ69ZK6 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Jmjd1cQ69ZK6 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Jmjd1cQ69ZK6 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Jmjd1cQ69ZK6 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Jmjd1cQ69ZK6 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Jmjd1cQ69ZK6 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Jmjd1cQ69ZK6 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Jmjd1cQ69ZK6 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Jmjd1cQ69ZK6 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Jmjd1cQ69ZK6 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Jmjd1cQ69ZK6 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Jmjd1cQ69ZK6 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Jmjd1cQ69ZK6 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Jmjd1cQ69ZK6 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Jmjd1cQ69ZK6 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Jmjd1cQ69ZK6 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Jmjd1cQ69ZK6 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Jmjd1cQ69ZK6 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Jmjd1cQ69ZK6 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Jmjd1cQ69ZK6 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Jmjd1cQ69ZK6 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Jmjd1cQ69ZK6 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Jmjd1cQ69ZK6 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Jmjd1cQ69ZK6 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 515.6 ms