Protein–RNA interactions for Protein: Q68FG3

Spty2d1, Protein SPT2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spty2d1Q68FG3 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Spty2d1Q68FG3 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Spty2d1Q68FG3 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Spty2d1Q68FG3 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Spty2d1Q68FG3 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Spty2d1Q68FG3 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Spty2d1Q68FG3 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Spty2d1Q68FG3 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Spty2d1Q68FG3 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Spty2d1Q68FG3 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Spty2d1Q68FG3 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Spty2d1Q68FG3 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Spty2d1Q68FG3 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Spty2d1Q68FG3 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Spty2d1Q68FG3 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Spty2d1Q68FG3 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Spty2d1Q68FG3 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Spty2d1Q68FG3 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Spty2d1Q68FG3 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Spty2d1Q68FG3 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Spty2d1Q68FG3 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Spty2d1Q68FG3 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Spty2d1Q68FG3 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Spty2d1Q68FG3 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Spty2d1Q68FG3 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Spty2d1Q68FG3 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Spty2d1Q68FG3 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Spty2d1Q68FG3 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Spty2d1Q68FG3 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Spty2d1Q68FG3 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Spty2d1Q68FG3 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Spty2d1Q68FG3 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Spty2d1Q68FG3 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Spty2d1Q68FG3 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Spty2d1Q68FG3 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Spty2d1Q68FG3 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Spty2d1Q68FG3 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Spty2d1Q68FG3 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Spty2d1Q68FG3 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Spty2d1Q68FG3 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Spty2d1Q68FG3 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Spty2d1Q68FG3 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Spty2d1Q68FG3 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Spty2d1Q68FG3 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Spty2d1Q68FG3 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Spty2d1Q68FG3 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Spty2d1Q68FG3 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Spty2d1Q68FG3 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Spty2d1Q68FG3 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Spty2d1Q68FG3 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Spty2d1Q68FG3 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Spty2d1Q68FG3 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Spty2d1Q68FG3 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Spty2d1Q68FG3 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Spty2d1Q68FG3 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Spty2d1Q68FG3 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Spty2d1Q68FG3 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Spty2d1Q68FG3 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Spty2d1Q68FG3 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Spty2d1Q68FG3 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Spty2d1Q68FG3 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Spty2d1Q68FG3 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Spty2d1Q68FG3 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Spty2d1Q68FG3 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Spty2d1Q68FG3 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Spty2d1Q68FG3 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Spty2d1Q68FG3 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Spty2d1Q68FG3 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Spty2d1Q68FG3 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Spty2d1Q68FG3 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Spty2d1Q68FG3 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Spty2d1Q68FG3 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Spty2d1Q68FG3 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Spty2d1Q68FG3 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Spty2d1Q68FG3 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Spty2d1Q68FG3 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Spty2d1Q68FG3 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Spty2d1Q68FG3 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Spty2d1Q68FG3 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Spty2d1Q68FG3 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Spty2d1Q68FG3 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Spty2d1Q68FG3 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Spty2d1Q68FG3 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Spty2d1Q68FG3 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Spty2d1Q68FG3 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Spty2d1Q68FG3 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Spty2d1Q68FG3 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Spty2d1Q68FG3 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Spty2d1Q68FG3 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Spty2d1Q68FG3 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Spty2d1Q68FG3 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Spty2d1Q68FG3 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Spty2d1Q68FG3 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Spty2d1Q68FG3 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Spty2d1Q68FG3 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Spty2d1Q68FG3 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Spty2d1Q68FG3 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Spty2d1Q68FG3 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Spty2d1Q68FG3 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Spty2d1Q68FG3 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms