Protein–RNA interactions for Protein: Q68EF0

Rab3ip, Rab-3A-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3ipQ68EF0 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rab3ipQ68EF0 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rab3ipQ68EF0 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rab3ipQ68EF0 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rab3ipQ68EF0 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rab3ipQ68EF0 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rab3ipQ68EF0 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rab3ipQ68EF0 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rab3ipQ68EF0 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rab3ipQ68EF0 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rab3ipQ68EF0 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rab3ipQ68EF0 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rab3ipQ68EF0 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rab3ipQ68EF0 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rab3ipQ68EF0 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rab3ipQ68EF0 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rab3ipQ68EF0 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rab3ipQ68EF0 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rab3ipQ68EF0 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rab3ipQ68EF0 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rab3ipQ68EF0 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rab3ipQ68EF0 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rab3ipQ68EF0 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rab3ipQ68EF0 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rab3ipQ68EF0 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rab3ipQ68EF0 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rab3ipQ68EF0 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rab3ipQ68EF0 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rab3ipQ68EF0 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rab3ipQ68EF0 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rab3ipQ68EF0 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Rab3ipQ68EF0 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rab3ipQ68EF0 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rab3ipQ68EF0 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rab3ipQ68EF0 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rab3ipQ68EF0 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rab3ipQ68EF0 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rab3ipQ68EF0 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rab3ipQ68EF0 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rab3ipQ68EF0 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rab3ipQ68EF0 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rab3ipQ68EF0 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rab3ipQ68EF0 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rab3ipQ68EF0 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rab3ipQ68EF0 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rab3ipQ68EF0 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rab3ipQ68EF0 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rab3ipQ68EF0 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rab3ipQ68EF0 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rab3ipQ68EF0 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rab3ipQ68EF0 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rab3ipQ68EF0 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rab3ipQ68EF0 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rab3ipQ68EF0 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Rab3ipQ68EF0 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rab3ipQ68EF0 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rab3ipQ68EF0 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rab3ipQ68EF0 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rab3ipQ68EF0 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rab3ipQ68EF0 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rab3ipQ68EF0 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rab3ipQ68EF0 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rab3ipQ68EF0 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rab3ipQ68EF0 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rab3ipQ68EF0 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rab3ipQ68EF0 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rab3ipQ68EF0 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rab3ipQ68EF0 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rab3ipQ68EF0 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rab3ipQ68EF0 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rab3ipQ68EF0 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rab3ipQ68EF0 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rab3ipQ68EF0 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rab3ipQ68EF0 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rab3ipQ68EF0 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rab3ipQ68EF0 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rab3ipQ68EF0 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rab3ipQ68EF0 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rab3ipQ68EF0 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rab3ipQ68EF0 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rab3ipQ68EF0 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rab3ipQ68EF0 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rab3ipQ68EF0 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rab3ipQ68EF0 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rab3ipQ68EF0 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Rab3ipQ68EF0 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rab3ipQ68EF0 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rab3ipQ68EF0 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rab3ipQ68EF0 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rab3ipQ68EF0 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rab3ipQ68EF0 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rab3ipQ68EF0 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rab3ipQ68EF0 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rab3ipQ68EF0 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rab3ipQ68EF0 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rab3ipQ68EF0 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rab3ipQ68EF0 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rab3ipQ68EF0 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rab3ipQ68EF0 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rab3ipQ68EF0 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms