Protein–RNA interactions for Protein: Q66K08

Cilp, Cartilage intermediate layer protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CilpQ66K08 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CilpQ66K08 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CilpQ66K08 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CilpQ66K08 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CilpQ66K08 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CilpQ66K08 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CilpQ66K08 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CilpQ66K08 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CilpQ66K08 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CilpQ66K08 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CilpQ66K08 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CilpQ66K08 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CilpQ66K08 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CilpQ66K08 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CilpQ66K08 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CilpQ66K08 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CilpQ66K08 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CilpQ66K08 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CilpQ66K08 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CilpQ66K08 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CilpQ66K08 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CilpQ66K08 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CilpQ66K08 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CilpQ66K08 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CilpQ66K08 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CilpQ66K08 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CilpQ66K08 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CilpQ66K08 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CilpQ66K08 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CilpQ66K08 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CilpQ66K08 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CilpQ66K08 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CilpQ66K08 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CilpQ66K08 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CilpQ66K08 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CilpQ66K08 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CilpQ66K08 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CilpQ66K08 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CilpQ66K08 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CilpQ66K08 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CilpQ66K08 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CilpQ66K08 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CilpQ66K08 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CilpQ66K08 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CilpQ66K08 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CilpQ66K08 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CilpQ66K08 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
CilpQ66K08 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CilpQ66K08 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CilpQ66K08 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CilpQ66K08 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CilpQ66K08 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CilpQ66K08 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CilpQ66K08 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CilpQ66K08 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CilpQ66K08 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CilpQ66K08 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CilpQ66K08 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CilpQ66K08 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CilpQ66K08 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CilpQ66K08 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CilpQ66K08 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CilpQ66K08 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CilpQ66K08 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CilpQ66K08 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CilpQ66K08 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CilpQ66K08 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CilpQ66K08 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CilpQ66K08 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CilpQ66K08 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CilpQ66K08 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CilpQ66K08 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CilpQ66K08 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CilpQ66K08 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CilpQ66K08 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CilpQ66K08 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CilpQ66K08 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CilpQ66K08 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CilpQ66K08 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CilpQ66K08 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CilpQ66K08 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CilpQ66K08 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CilpQ66K08 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CilpQ66K08 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CilpQ66K08 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CilpQ66K08 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CilpQ66K08 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CilpQ66K08 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CilpQ66K08 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CilpQ66K08 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CilpQ66K08 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CilpQ66K08 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CilpQ66K08 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CilpQ66K08 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CilpQ66K08 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CilpQ66K08 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CilpQ66K08 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CilpQ66K08 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CilpQ66K08 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CilpQ66K08 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms