Protein–RNA interactions for Protein: Q64518

Atp2a3, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2a3Q64518 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp2a3Q64518 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp2a3Q64518 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp2a3Q64518 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp2a3Q64518 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp2a3Q64518 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp2a3Q64518 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp2a3Q64518 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp2a3Q64518 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp2a3Q64518 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp2a3Q64518 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp2a3Q64518 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp2a3Q64518 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp2a3Q64518 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp2a3Q64518 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp2a3Q64518 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp2a3Q64518 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp2a3Q64518 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp2a3Q64518 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp2a3Q64518 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp2a3Q64518 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp2a3Q64518 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp2a3Q64518 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp2a3Q64518 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp2a3Q64518 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp2a3Q64518 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp2a3Q64518 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp2a3Q64518 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp2a3Q64518 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp2a3Q64518 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp2a3Q64518 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp2a3Q64518 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp2a3Q64518 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp2a3Q64518 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp2a3Q64518 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp2a3Q64518 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp2a3Q64518 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp2a3Q64518 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp2a3Q64518 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp2a3Q64518 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp2a3Q64518 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp2a3Q64518 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp2a3Q64518 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp2a3Q64518 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp2a3Q64518 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp2a3Q64518 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp2a3Q64518 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp2a3Q64518 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp2a3Q64518 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp2a3Q64518 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp2a3Q64518 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp2a3Q64518 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp2a3Q64518 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp2a3Q64518 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp2a3Q64518 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp2a3Q64518 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp2a3Q64518 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp2a3Q64518 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp2a3Q64518 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp2a3Q64518 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp2a3Q64518 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp2a3Q64518 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp2a3Q64518 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp2a3Q64518 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp2a3Q64518 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp2a3Q64518 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp2a3Q64518 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp2a3Q64518 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp2a3Q64518 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp2a3Q64518 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp2a3Q64518 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp2a3Q64518 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp2a3Q64518 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp2a3Q64518 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp2a3Q64518 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp2a3Q64518 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp2a3Q64518 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp2a3Q64518 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp2a3Q64518 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp2a3Q64518 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp2a3Q64518 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp2a3Q64518 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp2a3Q64518 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp2a3Q64518 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp2a3Q64518 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp2a3Q64518 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp2a3Q64518 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp2a3Q64518 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp2a3Q64518 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp2a3Q64518 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp2a3Q64518 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp2a3Q64518 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp2a3Q64518 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp2a3Q64518 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp2a3Q64518 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp2a3Q64518 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp2a3Q64518 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp2a3Q64518 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp2a3Q64518 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atp2a3Q64518 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms