Protein–RNA interactions for Protein: Q64511

Top2b, DNA topoisomerase 2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2bQ64511 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC30■■■□□ 2.39
Top2bQ64511 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Top2bQ64511 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC30■■■□□ 2.39
Top2bQ64511 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Top2bQ64511 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Top2bQ64511 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Top2bQ64511 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
Top2bQ64511 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC30■■■□□ 2.39
Top2bQ64511 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
Top2bQ64511 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
Top2bQ64511 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Top2bQ64511 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
Top2bQ64511 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Top2bQ64511 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Top2bQ64511 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Top2bQ64511 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Top2bQ64511 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Top2bQ64511 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Top2bQ64511 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Top2bQ64511 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Top2bQ64511 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Top2bQ64511 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Top2bQ64511 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Top2bQ64511 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Top2bQ64511 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Top2bQ64511 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Top2bQ64511 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Top2bQ64511 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Top2bQ64511 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Top2bQ64511 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Top2bQ64511 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Top2bQ64511 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Top2bQ64511 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Top2bQ64511 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Top2bQ64511 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Top2bQ64511 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Top2bQ64511 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Top2bQ64511 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Top2bQ64511 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Top2bQ64511 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Top2bQ64511 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Top2bQ64511 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Top2bQ64511 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Top2bQ64511 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Top2bQ64511 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Top2bQ64511 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
Top2bQ64511 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Top2bQ64511 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
Top2bQ64511 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Top2bQ64511 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Top2bQ64511 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
Top2bQ64511 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Top2bQ64511 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Top2bQ64511 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Top2bQ64511 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Top2bQ64511 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Top2bQ64511 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Top2bQ64511 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Top2bQ64511 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Top2bQ64511 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Top2bQ64511 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
Top2bQ64511 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Top2bQ64511 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Top2bQ64511 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Top2bQ64511 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
Top2bQ64511 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
Top2bQ64511 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Top2bQ64511 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Top2bQ64511 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Top2bQ64511 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Top2bQ64511 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Top2bQ64511 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Top2bQ64511 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Top2bQ64511 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
Top2bQ64511 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Top2bQ64511 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Top2bQ64511 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Top2bQ64511 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Top2bQ64511 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Top2bQ64511 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Top2bQ64511 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Top2bQ64511 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Top2bQ64511 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Top2bQ64511 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Top2bQ64511 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Top2bQ64511 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Top2bQ64511 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Top2bQ64511 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Top2bQ64511 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Top2bQ64511 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
Top2bQ64511 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
Top2bQ64511 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Top2bQ64511 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Top2bQ64511 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Top2bQ64511 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Top2bQ64511 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Top2bQ64511 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Top2bQ64511 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Top2bQ64511 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC29.89■■■□□ 2.37
Top2bQ64511 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC29.89■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms