Protein–RNA interactions for Protein: Q64487

Ptprd, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, mousemouse

Predictions only

Length 1,912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprdQ64487 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PtprdQ64487 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PtprdQ64487 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PtprdQ64487 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PtprdQ64487 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PtprdQ64487 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PtprdQ64487 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PtprdQ64487 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PtprdQ64487 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PtprdQ64487 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PtprdQ64487 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PtprdQ64487 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PtprdQ64487 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PtprdQ64487 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PtprdQ64487 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PtprdQ64487 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PtprdQ64487 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PtprdQ64487 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PtprdQ64487 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PtprdQ64487 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PtprdQ64487 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PtprdQ64487 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PtprdQ64487 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PtprdQ64487 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PtprdQ64487 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PtprdQ64487 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
PtprdQ64487 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PtprdQ64487 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PtprdQ64487 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PtprdQ64487 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PtprdQ64487 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PtprdQ64487 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PtprdQ64487 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PtprdQ64487 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PtprdQ64487 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PtprdQ64487 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PtprdQ64487 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PtprdQ64487 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PtprdQ64487 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PtprdQ64487 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PtprdQ64487 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PtprdQ64487 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PtprdQ64487 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PtprdQ64487 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PtprdQ64487 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PtprdQ64487 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PtprdQ64487 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PtprdQ64487 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PtprdQ64487 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PtprdQ64487 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PtprdQ64487 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PtprdQ64487 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PtprdQ64487 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PtprdQ64487 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PtprdQ64487 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PtprdQ64487 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PtprdQ64487 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PtprdQ64487 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PtprdQ64487 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PtprdQ64487 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PtprdQ64487 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PtprdQ64487 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PtprdQ64487 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PtprdQ64487 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PtprdQ64487 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PtprdQ64487 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PtprdQ64487 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PtprdQ64487 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PtprdQ64487 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PtprdQ64487 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PtprdQ64487 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PtprdQ64487 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PtprdQ64487 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PtprdQ64487 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PtprdQ64487 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PtprdQ64487 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PtprdQ64487 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PtprdQ64487 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PtprdQ64487 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PtprdQ64487 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PtprdQ64487 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PtprdQ64487 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PtprdQ64487 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PtprdQ64487 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PtprdQ64487 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PtprdQ64487 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PtprdQ64487 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PtprdQ64487 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PtprdQ64487 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PtprdQ64487 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PtprdQ64487 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PtprdQ64487 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PtprdQ64487 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PtprdQ64487 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PtprdQ64487 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PtprdQ64487 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PtprdQ64487 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PtprdQ64487 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PtprdQ64487 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PtprdQ64487 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms