Protein–RNA interactions for Protein: Q640Q5

Pan3, PAN2-PAN3 deadenylation complex subunit Pan3, mousemouse

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Length 837 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pan3Q640Q5 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pan3Q640Q5 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pan3Q640Q5 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pan3Q640Q5 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pan3Q640Q5 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pan3Q640Q5 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Pan3Q640Q5 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pan3Q640Q5 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Pan3Q640Q5 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Pan3Q640Q5 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pan3Q640Q5 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pan3Q640Q5 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pan3Q640Q5 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pan3Q640Q5 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pan3Q640Q5 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pan3Q640Q5 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pan3Q640Q5 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pan3Q640Q5 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pan3Q640Q5 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pan3Q640Q5 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Pan3Q640Q5 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pan3Q640Q5 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pan3Q640Q5 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pan3Q640Q5 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pan3Q640Q5 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pan3Q640Q5 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pan3Q640Q5 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pan3Q640Q5 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pan3Q640Q5 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pan3Q640Q5 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pan3Q640Q5 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pan3Q640Q5 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Pan3Q640Q5 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pan3Q640Q5 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pan3Q640Q5 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pan3Q640Q5 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pan3Q640Q5 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pan3Q640Q5 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pan3Q640Q5 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pan3Q640Q5 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Pan3Q640Q5 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pan3Q640Q5 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pan3Q640Q5 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pan3Q640Q5 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pan3Q640Q5 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pan3Q640Q5 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pan3Q640Q5 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pan3Q640Q5 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pan3Q640Q5 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pan3Q640Q5 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pan3Q640Q5 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pan3Q640Q5 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pan3Q640Q5 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pan3Q640Q5 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pan3Q640Q5 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pan3Q640Q5 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pan3Q640Q5 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pan3Q640Q5 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pan3Q640Q5 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pan3Q640Q5 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pan3Q640Q5 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pan3Q640Q5 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pan3Q640Q5 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Pan3Q640Q5 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pan3Q640Q5 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Pan3Q640Q5 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Pan3Q640Q5 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Pan3Q640Q5 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pan3Q640Q5 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pan3Q640Q5 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pan3Q640Q5 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pan3Q640Q5 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pan3Q640Q5 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pan3Q640Q5 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pan3Q640Q5 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pan3Q640Q5 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pan3Q640Q5 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pan3Q640Q5 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pan3Q640Q5 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pan3Q640Q5 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pan3Q640Q5 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pan3Q640Q5 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pan3Q640Q5 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pan3Q640Q5 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Pan3Q640Q5 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pan3Q640Q5 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pan3Q640Q5 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pan3Q640Q5 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pan3Q640Q5 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pan3Q640Q5 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pan3Q640Q5 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pan3Q640Q5 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pan3Q640Q5 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Pan3Q640Q5 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pan3Q640Q5 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pan3Q640Q5 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pan3Q640Q5 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pan3Q640Q5 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pan3Q640Q5 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pan3Q640Q5 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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