Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW7

Patj, InaD-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PatjQ63ZW7 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PatjQ63ZW7 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PatjQ63ZW7 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PatjQ63ZW7 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PatjQ63ZW7 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PatjQ63ZW7 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PatjQ63ZW7 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PatjQ63ZW7 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PatjQ63ZW7 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PatjQ63ZW7 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PatjQ63ZW7 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PatjQ63ZW7 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PatjQ63ZW7 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PatjQ63ZW7 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
PatjQ63ZW7 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PatjQ63ZW7 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PatjQ63ZW7 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PatjQ63ZW7 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PatjQ63ZW7 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PatjQ63ZW7 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
PatjQ63ZW7 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PatjQ63ZW7 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PatjQ63ZW7 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PatjQ63ZW7 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PatjQ63ZW7 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PatjQ63ZW7 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PatjQ63ZW7 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PatjQ63ZW7 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PatjQ63ZW7 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PatjQ63ZW7 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PatjQ63ZW7 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PatjQ63ZW7 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PatjQ63ZW7 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PatjQ63ZW7 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PatjQ63ZW7 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PatjQ63ZW7 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PatjQ63ZW7 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PatjQ63ZW7 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PatjQ63ZW7 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PatjQ63ZW7 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PatjQ63ZW7 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PatjQ63ZW7 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PatjQ63ZW7 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PatjQ63ZW7 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PatjQ63ZW7 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PatjQ63ZW7 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PatjQ63ZW7 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PatjQ63ZW7 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PatjQ63ZW7 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PatjQ63ZW7 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PatjQ63ZW7 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PatjQ63ZW7 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PatjQ63ZW7 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PatjQ63ZW7 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PatjQ63ZW7 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PatjQ63ZW7 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PatjQ63ZW7 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
PatjQ63ZW7 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PatjQ63ZW7 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PatjQ63ZW7 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PatjQ63ZW7 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PatjQ63ZW7 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PatjQ63ZW7 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PatjQ63ZW7 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PatjQ63ZW7 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PatjQ63ZW7 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PatjQ63ZW7 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PatjQ63ZW7 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PatjQ63ZW7 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PatjQ63ZW7 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PatjQ63ZW7 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PatjQ63ZW7 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PatjQ63ZW7 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PatjQ63ZW7 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PatjQ63ZW7 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PatjQ63ZW7 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PatjQ63ZW7 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
PatjQ63ZW7 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
PatjQ63ZW7 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PatjQ63ZW7 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PatjQ63ZW7 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PatjQ63ZW7 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PatjQ63ZW7 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PatjQ63ZW7 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PatjQ63ZW7 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PatjQ63ZW7 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PatjQ63ZW7 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PatjQ63ZW7 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PatjQ63ZW7 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
PatjQ63ZW7 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PatjQ63ZW7 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PatjQ63ZW7 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
PatjQ63ZW7 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PatjQ63ZW7 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PatjQ63ZW7 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PatjQ63ZW7 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PatjQ63ZW7 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PatjQ63ZW7 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PatjQ63ZW7 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PatjQ63ZW7 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms