Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW6

Col4a5, Col4a5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a5Q63ZW6 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Col4a5Q63ZW6 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Col4a5Q63ZW6 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Col4a5Q63ZW6 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Col4a5Q63ZW6 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Col4a5Q63ZW6 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Col4a5Q63ZW6 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Col4a5Q63ZW6 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Col4a5Q63ZW6 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Col4a5Q63ZW6 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Col4a5Q63ZW6 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Col4a5Q63ZW6 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Col4a5Q63ZW6 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Col4a5Q63ZW6 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Col4a5Q63ZW6 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Col4a5Q63ZW6 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Col4a5Q63ZW6 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Col4a5Q63ZW6 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Col4a5Q63ZW6 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Col4a5Q63ZW6 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Col4a5Q63ZW6 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Col4a5Q63ZW6 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Col4a5Q63ZW6 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Col4a5Q63ZW6 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Col4a5Q63ZW6 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Col4a5Q63ZW6 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Col4a5Q63ZW6 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Col4a5Q63ZW6 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Col4a5Q63ZW6 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Col4a5Q63ZW6 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Col4a5Q63ZW6 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Col4a5Q63ZW6 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Col4a5Q63ZW6 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Col4a5Q63ZW6 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Col4a5Q63ZW6 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Col4a5Q63ZW6 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Col4a5Q63ZW6 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Col4a5Q63ZW6 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Col4a5Q63ZW6 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Col4a5Q63ZW6 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Col4a5Q63ZW6 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Col4a5Q63ZW6 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Col4a5Q63ZW6 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Col4a5Q63ZW6 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Col4a5Q63ZW6 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Col4a5Q63ZW6 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Col4a5Q63ZW6 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Col4a5Q63ZW6 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Col4a5Q63ZW6 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Col4a5Q63ZW6 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Col4a5Q63ZW6 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Col4a5Q63ZW6 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Col4a5Q63ZW6 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Col4a5Q63ZW6 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Col4a5Q63ZW6 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Col4a5Q63ZW6 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Col4a5Q63ZW6 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Col4a5Q63ZW6 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Col4a5Q63ZW6 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Col4a5Q63ZW6 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Col4a5Q63ZW6 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Col4a5Q63ZW6 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Col4a5Q63ZW6 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Col4a5Q63ZW6 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Col4a5Q63ZW6 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Col4a5Q63ZW6 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Col4a5Q63ZW6 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Col4a5Q63ZW6 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Col4a5Q63ZW6 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Col4a5Q63ZW6 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Col4a5Q63ZW6 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Col4a5Q63ZW6 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Col4a5Q63ZW6 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Col4a5Q63ZW6 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Col4a5Q63ZW6 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Col4a5Q63ZW6 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Col4a5Q63ZW6 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Col4a5Q63ZW6 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Col4a5Q63ZW6 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Col4a5Q63ZW6 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Col4a5Q63ZW6 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Col4a5Q63ZW6 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Col4a5Q63ZW6 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Col4a5Q63ZW6 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Col4a5Q63ZW6 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Col4a5Q63ZW6 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Col4a5Q63ZW6 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Col4a5Q63ZW6 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Col4a5Q63ZW6 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Col4a5Q63ZW6 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Col4a5Q63ZW6 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Col4a5Q63ZW6 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Col4a5Q63ZW6 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Col4a5Q63ZW6 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Col4a5Q63ZW6 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Col4a5Q63ZW6 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Col4a5Q63ZW6 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Col4a5Q63ZW6 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Col4a5Q63ZW6 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Col4a5Q63ZW6 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms