Protein–RNA interactions for Protein: Q62513

Znf260, Zinc finger protein 260, mousemouse

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Length 407 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf260Q62513 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Znf260Q62513 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Znf260Q62513 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Znf260Q62513 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Znf260Q62513 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Znf260Q62513 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Znf260Q62513 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Znf260Q62513 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Znf260Q62513 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Znf260Q62513 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Znf260Q62513 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Znf260Q62513 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Znf260Q62513 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Znf260Q62513 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Znf260Q62513 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Znf260Q62513 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Znf260Q62513 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Znf260Q62513 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Znf260Q62513 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Znf260Q62513 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Znf260Q62513 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Znf260Q62513 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Znf260Q62513 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Znf260Q62513 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Znf260Q62513 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Znf260Q62513 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Znf260Q62513 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Znf260Q62513 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Znf260Q62513 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Znf260Q62513 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Znf260Q62513 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Znf260Q62513 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Znf260Q62513 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Znf260Q62513 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Znf260Q62513 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Znf260Q62513 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Znf260Q62513 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Znf260Q62513 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Znf260Q62513 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Znf260Q62513 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Znf260Q62513 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Znf260Q62513 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Znf260Q62513 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Znf260Q62513 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Znf260Q62513 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Znf260Q62513 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Znf260Q62513 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Znf260Q62513 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Znf260Q62513 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Znf260Q62513 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Znf260Q62513 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Znf260Q62513 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Znf260Q62513 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Znf260Q62513 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Znf260Q62513 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Znf260Q62513 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Znf260Q62513 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Znf260Q62513 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Znf260Q62513 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Znf260Q62513 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Znf260Q62513 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Znf260Q62513 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Znf260Q62513 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Znf260Q62513 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Znf260Q62513 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Znf260Q62513 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Znf260Q62513 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Znf260Q62513 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Znf260Q62513 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Znf260Q62513 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Znf260Q62513 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Znf260Q62513 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Znf260Q62513 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Znf260Q62513 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Znf260Q62513 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Znf260Q62513 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Znf260Q62513 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Znf260Q62513 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Znf260Q62513 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Znf260Q62513 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Znf260Q62513 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Znf260Q62513 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Znf260Q62513 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Znf260Q62513 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Znf260Q62513 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Znf260Q62513 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Znf260Q62513 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Znf260Q62513 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Znf260Q62513 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Znf260Q62513 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Znf260Q62513 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Znf260Q62513 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Znf260Q62513 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Znf260Q62513 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Znf260Q62513 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Znf260Q62513 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Znf260Q62513 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Znf260Q62513 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Znf260Q62513 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Znf260Q62513 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms