Protein–RNA interactions for Protein: Q62460

Gm20865, (clone BALB3N), mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20865Q62460 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Gm20865Q62460 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm20865Q62460 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm20865Q62460 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm20865Q62460 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm20865Q62460 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm20865Q62460 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm20865Q62460 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm20865Q62460 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm20865Q62460 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm20865Q62460 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm20865Q62460 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm20865Q62460 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm20865Q62460 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm20865Q62460 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm20865Q62460 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm20865Q62460 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20865Q62460 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20865Q62460 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20865Q62460 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20865Q62460 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20865Q62460 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20865Q62460 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20865Q62460 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20865Q62460 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20865Q62460 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20865Q62460 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20865Q62460 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20865Q62460 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20865Q62460 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20865Q62460 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20865Q62460 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20865Q62460 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20865Q62460 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20865Q62460 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20865Q62460 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20865Q62460 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20865Q62460 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20865Q62460 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20865Q62460 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20865Q62460 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20865Q62460 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20865Q62460 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20865Q62460 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gm20865Q62460 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20865Q62460 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20865Q62460 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20865Q62460 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20865Q62460 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20865Q62460 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20865Q62460 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20865Q62460 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20865Q62460 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20865Q62460 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20865Q62460 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm20865Q62460 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm20865Q62460 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm20865Q62460 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm20865Q62460 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm20865Q62460 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm20865Q62460 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm20865Q62460 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm20865Q62460 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm20865Q62460 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm20865Q62460 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm20865Q62460 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm20865Q62460 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm20865Q62460 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm20865Q62460 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm20865Q62460 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm20865Q62460 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm20865Q62460 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm20865Q62460 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm20865Q62460 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm20865Q62460 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm20865Q62460 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm20865Q62460 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm20865Q62460 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm20865Q62460 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm20865Q62460 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm20865Q62460 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm20865Q62460 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm20865Q62460 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm20865Q62460 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm20865Q62460 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm20865Q62460 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm20865Q62460 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm20865Q62460 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm20865Q62460 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm20865Q62460 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm20865Q62460 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm20865Q62460 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm20865Q62460 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm20865Q62460 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm20865Q62460 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm20865Q62460 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm20865Q62460 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm20865Q62460 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Gm20865Q62460 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm20865Q62460 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms