Protein–RNA interactions for Protein: Q62447

Ccnc, Cyclin-C, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcncQ62447 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CcncQ62447 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CcncQ62447 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CcncQ62447 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CcncQ62447 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CcncQ62447 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CcncQ62447 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CcncQ62447 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CcncQ62447 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CcncQ62447 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CcncQ62447 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CcncQ62447 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CcncQ62447 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CcncQ62447 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CcncQ62447 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CcncQ62447 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CcncQ62447 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CcncQ62447 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CcncQ62447 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CcncQ62447 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CcncQ62447 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CcncQ62447 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CcncQ62447 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CcncQ62447 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CcncQ62447 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CcncQ62447 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CcncQ62447 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CcncQ62447 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CcncQ62447 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CcncQ62447 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CcncQ62447 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CcncQ62447 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CcncQ62447 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CcncQ62447 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CcncQ62447 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CcncQ62447 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CcncQ62447 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CcncQ62447 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CcncQ62447 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CcncQ62447 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CcncQ62447 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CcncQ62447 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CcncQ62447 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CcncQ62447 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CcncQ62447 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CcncQ62447 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CcncQ62447 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CcncQ62447 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CcncQ62447 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CcncQ62447 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CcncQ62447 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CcncQ62447 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CcncQ62447 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CcncQ62447 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CcncQ62447 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CcncQ62447 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CcncQ62447 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CcncQ62447 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CcncQ62447 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CcncQ62447 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CcncQ62447 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CcncQ62447 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CcncQ62447 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CcncQ62447 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CcncQ62447 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CcncQ62447 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CcncQ62447 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CcncQ62447 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CcncQ62447 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CcncQ62447 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CcncQ62447 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CcncQ62447 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CcncQ62447 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CcncQ62447 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CcncQ62447 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CcncQ62447 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CcncQ62447 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CcncQ62447 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CcncQ62447 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CcncQ62447 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CcncQ62447 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CcncQ62447 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
CcncQ62447 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CcncQ62447 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CcncQ62447 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CcncQ62447 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CcncQ62447 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CcncQ62447 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CcncQ62447 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CcncQ62447 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CcncQ62447 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CcncQ62447 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CcncQ62447 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CcncQ62447 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CcncQ62447 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CcncQ62447 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CcncQ62447 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CcncQ62447 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CcncQ62447 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CcncQ62447 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms