Protein–RNA interactions for Protein: Q62425

Ndufa4, Cytochrome c oxidase subunit NDUFA4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 82 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufa4Q62425 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ndufa4Q62425 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ndufa4Q62425 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ndufa4Q62425 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ndufa4Q62425 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ndufa4Q62425 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ndufa4Q62425 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ndufa4Q62425 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ndufa4Q62425 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ndufa4Q62425 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ndufa4Q62425 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ndufa4Q62425 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ndufa4Q62425 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ndufa4Q62425 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ndufa4Q62425 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ndufa4Q62425 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ndufa4Q62425 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ndufa4Q62425 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ndufa4Q62425 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ndufa4Q62425 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ndufa4Q62425 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ndufa4Q62425 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ndufa4Q62425 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ndufa4Q62425 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ndufa4Q62425 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ndufa4Q62425 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ndufa4Q62425 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ndufa4Q62425 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ndufa4Q62425 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ndufa4Q62425 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ndufa4Q62425 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ndufa4Q62425 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ndufa4Q62425 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ndufa4Q62425 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ndufa4Q62425 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ndufa4Q62425 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ndufa4Q62425 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ndufa4Q62425 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ndufa4Q62425 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ndufa4Q62425 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ndufa4Q62425 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ndufa4Q62425 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ndufa4Q62425 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ndufa4Q62425 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ndufa4Q62425 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ndufa4Q62425 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ndufa4Q62425 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ndufa4Q62425 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ndufa4Q62425 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ndufa4Q62425 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ndufa4Q62425 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ndufa4Q62425 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ndufa4Q62425 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ndufa4Q62425 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ndufa4Q62425 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ndufa4Q62425 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ndufa4Q62425 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ndufa4Q62425 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ndufa4Q62425 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ndufa4Q62425 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ndufa4Q62425 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ndufa4Q62425 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ndufa4Q62425 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ndufa4Q62425 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ndufa4Q62425 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ndufa4Q62425 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ndufa4Q62425 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ndufa4Q62425 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ndufa4Q62425 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ndufa4Q62425 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ndufa4Q62425 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ndufa4Q62425 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ndufa4Q62425 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ndufa4Q62425 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ndufa4Q62425 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ndufa4Q62425 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ndufa4Q62425 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ndufa4Q62425 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ndufa4Q62425 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ndufa4Q62425 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ndufa4Q62425 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ndufa4Q62425 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ndufa4Q62425 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ndufa4Q62425 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ndufa4Q62425 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ndufa4Q62425 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ndufa4Q62425 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ndufa4Q62425 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ndufa4Q62425 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ndufa4Q62425 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ndufa4Q62425 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ndufa4Q62425 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ndufa4Q62425 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ndufa4Q62425 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ndufa4Q62425 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ndufa4Q62425 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ndufa4Q62425 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ndufa4Q62425 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ndufa4Q62425 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ndufa4Q62425 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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