Protein–RNA interactions for Protein: Q62424

Hoxa13, Homeobox protein Hox-A13, mousemouse

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Length 386 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa13Q62424 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hoxa13Q62424 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hoxa13Q62424 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hoxa13Q62424 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hoxa13Q62424 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hoxa13Q62424 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hoxa13Q62424 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hoxa13Q62424 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Hoxa13Q62424 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hoxa13Q62424 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hoxa13Q62424 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hoxa13Q62424 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hoxa13Q62424 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hoxa13Q62424 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hoxa13Q62424 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hoxa13Q62424 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hoxa13Q62424 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hoxa13Q62424 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hoxa13Q62424 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hoxa13Q62424 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hoxa13Q62424 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hoxa13Q62424 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hoxa13Q62424 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hoxa13Q62424 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hoxa13Q62424 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hoxa13Q62424 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Hoxa13Q62424 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hoxa13Q62424 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hoxa13Q62424 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hoxa13Q62424 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hoxa13Q62424 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hoxa13Q62424 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hoxa13Q62424 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hoxa13Q62424 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hoxa13Q62424 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Hoxa13Q62424 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hoxa13Q62424 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Hoxa13Q62424 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hoxa13Q62424 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Hoxa13Q62424 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hoxa13Q62424 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hoxa13Q62424 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Hoxa13Q62424 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hoxa13Q62424 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hoxa13Q62424 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hoxa13Q62424 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hoxa13Q62424 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Hoxa13Q62424 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hoxa13Q62424 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hoxa13Q62424 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hoxa13Q62424 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hoxa13Q62424 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hoxa13Q62424 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hoxa13Q62424 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Hoxa13Q62424 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hoxa13Q62424 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hoxa13Q62424 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Hoxa13Q62424 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hoxa13Q62424 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hoxa13Q62424 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hoxa13Q62424 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hoxa13Q62424 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hoxa13Q62424 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hoxa13Q62424 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hoxa13Q62424 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hoxa13Q62424 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hoxa13Q62424 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hoxa13Q62424 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hoxa13Q62424 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hoxa13Q62424 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hoxa13Q62424 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hoxa13Q62424 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hoxa13Q62424 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hoxa13Q62424 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hoxa13Q62424 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hoxa13Q62424 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hoxa13Q62424 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Hoxa13Q62424 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hoxa13Q62424 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hoxa13Q62424 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Hoxa13Q62424 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hoxa13Q62424 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hoxa13Q62424 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hoxa13Q62424 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hoxa13Q62424 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hoxa13Q62424 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hoxa13Q62424 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hoxa13Q62424 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Hoxa13Q62424 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hoxa13Q62424 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hoxa13Q62424 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hoxa13Q62424 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hoxa13Q62424 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hoxa13Q62424 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hoxa13Q62424 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hoxa13Q62424 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hoxa13Q62424 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hoxa13Q62424 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hoxa13Q62424 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hoxa13Q62424 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
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