Protein–RNA interactions for Protein: Q62361

Trh, Pro-thyrotropin-releasing hormone, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrhQ62361 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TrhQ62361 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TrhQ62361 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TrhQ62361 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TrhQ62361 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TrhQ62361 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TrhQ62361 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TrhQ62361 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TrhQ62361 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TrhQ62361 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TrhQ62361 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TrhQ62361 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TrhQ62361 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
TrhQ62361 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TrhQ62361 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TrhQ62361 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TrhQ62361 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TrhQ62361 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TrhQ62361 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TrhQ62361 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TrhQ62361 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TrhQ62361 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TrhQ62361 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TrhQ62361 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TrhQ62361 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TrhQ62361 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TrhQ62361 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TrhQ62361 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TrhQ62361 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TrhQ62361 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TrhQ62361 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TrhQ62361 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TrhQ62361 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TrhQ62361 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TrhQ62361 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TrhQ62361 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TrhQ62361 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TrhQ62361 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TrhQ62361 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TrhQ62361 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TrhQ62361 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TrhQ62361 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TrhQ62361 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TrhQ62361 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TrhQ62361 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TrhQ62361 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TrhQ62361 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TrhQ62361 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TrhQ62361 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TrhQ62361 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TrhQ62361 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TrhQ62361 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TrhQ62361 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TrhQ62361 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TrhQ62361 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TrhQ62361 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TrhQ62361 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TrhQ62361 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TrhQ62361 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TrhQ62361 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TrhQ62361 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TrhQ62361 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TrhQ62361 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TrhQ62361 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TrhQ62361 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TrhQ62361 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TrhQ62361 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TrhQ62361 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TrhQ62361 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TrhQ62361 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TrhQ62361 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TrhQ62361 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TrhQ62361 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TrhQ62361 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TrhQ62361 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TrhQ62361 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TrhQ62361 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TrhQ62361 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TrhQ62361 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TrhQ62361 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TrhQ62361 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TrhQ62361 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TrhQ62361 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TrhQ62361 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TrhQ62361 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TrhQ62361 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TrhQ62361 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TrhQ62361 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TrhQ62361 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TrhQ62361 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TrhQ62361 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TrhQ62361 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TrhQ62361 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TrhQ62361 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TrhQ62361 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TrhQ62361 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TrhQ62361 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TrhQ62361 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TrhQ62361 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TrhQ62361 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms