Protein–RNA interactions for Protein: Q62280

Ss18, Protein SSXT, mousemouse

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ss18Q62280 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ss18Q62280 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ss18Q62280 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ss18Q62280 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ss18Q62280 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ss18Q62280 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ss18Q62280 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ss18Q62280 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ss18Q62280 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ss18Q62280 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ss18Q62280 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ss18Q62280 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ss18Q62280 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ss18Q62280 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ss18Q62280 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ss18Q62280 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ss18Q62280 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ss18Q62280 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ss18Q62280 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ss18Q62280 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ss18Q62280 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ss18Q62280 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ss18Q62280 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ss18Q62280 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ss18Q62280 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ss18Q62280 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ss18Q62280 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ss18Q62280 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ss18Q62280 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ss18Q62280 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ss18Q62280 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ss18Q62280 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ss18Q62280 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ss18Q62280 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ss18Q62280 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ss18Q62280 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ss18Q62280 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ss18Q62280 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ss18Q62280 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ss18Q62280 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ss18Q62280 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ss18Q62280 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Ss18Q62280 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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Ss18Q62280 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ss18Q62280 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ss18Q62280 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ss18Q62280 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ss18Q62280 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ss18Q62280 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ss18Q62280 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ss18Q62280 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ss18Q62280 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ss18Q62280 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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Ss18Q62280 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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Ss18Q62280 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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Ss18Q62280 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ss18Q62280 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ss18Q62280 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ss18Q62280 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ss18Q62280 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ss18Q62280 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ss18Q62280 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ss18Q62280 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ss18Q62280 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ss18Q62280 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ss18Q62280 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ss18Q62280 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ss18Q62280 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ss18Q62280 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ss18Q62280 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ss18Q62280 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ss18Q62280 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ss18Q62280 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ss18Q62280 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ss18Q62280 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ss18Q62280 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ss18Q62280 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ss18Q62280 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ss18Q62280 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ss18Q62280 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ss18Q62280 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ss18Q62280 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ss18Q62280 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ss18Q62280 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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