Protein–RNA interactions for Protein: Q62255

Sall3, Sal-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall3Q62255 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Sall3Q62255 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sall3Q62255 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sall3Q62255 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sall3Q62255 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Sall3Q62255 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sall3Q62255 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sall3Q62255 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sall3Q62255 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sall3Q62255 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sall3Q62255 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sall3Q62255 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sall3Q62255 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sall3Q62255 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sall3Q62255 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sall3Q62255 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sall3Q62255 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sall3Q62255 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sall3Q62255 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sall3Q62255 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sall3Q62255 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sall3Q62255 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sall3Q62255 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sall3Q62255 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sall3Q62255 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sall3Q62255 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sall3Q62255 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sall3Q62255 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sall3Q62255 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sall3Q62255 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sall3Q62255 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sall3Q62255 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Sall3Q62255 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sall3Q62255 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sall3Q62255 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sall3Q62255 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sall3Q62255 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sall3Q62255 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sall3Q62255 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Sall3Q62255 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sall3Q62255 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sall3Q62255 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sall3Q62255 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Sall3Q62255 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Sall3Q62255 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Sall3Q62255 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Sall3Q62255 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sall3Q62255 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sall3Q62255 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sall3Q62255 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sall3Q62255 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sall3Q62255 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sall3Q62255 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sall3Q62255 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sall3Q62255 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sall3Q62255 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sall3Q62255 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sall3Q62255 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sall3Q62255 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sall3Q62255 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sall3Q62255 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sall3Q62255 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sall3Q62255 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sall3Q62255 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sall3Q62255 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sall3Q62255 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sall3Q62255 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sall3Q62255 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sall3Q62255 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Sall3Q62255 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sall3Q62255 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sall3Q62255 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sall3Q62255 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sall3Q62255 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sall3Q62255 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sall3Q62255 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sall3Q62255 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sall3Q62255 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sall3Q62255 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sall3Q62255 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sall3Q62255 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sall3Q62255 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sall3Q62255 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sall3Q62255 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sall3Q62255 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sall3Q62255 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Sall3Q62255 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Sall3Q62255 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sall3Q62255 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sall3Q62255 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sall3Q62255 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sall3Q62255 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sall3Q62255 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sall3Q62255 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sall3Q62255 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sall3Q62255 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sall3Q62255 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sall3Q62255 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sall3Q62255 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sall3Q62255 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms