Protein–RNA interactions for Protein: Q62240

Kdm5d, Lysine-specific demethylase 5D, mousemouse

Predictions only

Length 1,548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5dQ62240 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
Kdm5dQ62240 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
Kdm5dQ62240 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Kdm5dQ62240 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Kdm5dQ62240 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Kdm5dQ62240 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Kdm5dQ62240 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Kdm5dQ62240 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Kdm5dQ62240 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Kdm5dQ62240 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
Kdm5dQ62240 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
Kdm5dQ62240 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
Kdm5dQ62240 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Kdm5dQ62240 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Kdm5dQ62240 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC33.84■■■■□ 3.01
Kdm5dQ62240 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
Kdm5dQ62240 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Kdm5dQ62240 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Kdm5dQ62240 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Kdm5dQ62240 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Kdm5dQ62240 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Kdm5dQ62240 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
Kdm5dQ62240 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Kdm5dQ62240 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
Kdm5dQ62240 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC33.84■■■■□ 3.01
Kdm5dQ62240 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Kdm5dQ62240 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Kdm5dQ62240 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
Kdm5dQ62240 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Kdm5dQ62240 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
Kdm5dQ62240 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Kdm5dQ62240 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
Kdm5dQ62240 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Kdm5dQ62240 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
Kdm5dQ62240 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Kdm5dQ62240 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC33.82■■■■□ 3
Kdm5dQ62240 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC33.82■■■■□ 3
Kdm5dQ62240 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
Kdm5dQ62240 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
Kdm5dQ62240 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Kdm5dQ62240 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Kdm5dQ62240 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC33.82■■■■□ 3
Kdm5dQ62240 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Kdm5dQ62240 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.81■■■■□ 3
Kdm5dQ62240 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
Kdm5dQ62240 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC33.81■■■■□ 3
Kdm5dQ62240 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.81■■■■□ 3
Kdm5dQ62240 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Kdm5dQ62240 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Kdm5dQ62240 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Kdm5dQ62240 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Kdm5dQ62240 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Kdm5dQ62240 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Kdm5dQ62240 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Kdm5dQ62240 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC33.8■■■■□ 3
Kdm5dQ62240 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
Kdm5dQ62240 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
Kdm5dQ62240 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Kdm5dQ62240 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Kdm5dQ62240 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Kdm5dQ62240 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Kdm5dQ62240 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Kdm5dQ62240 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Kdm5dQ62240 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.79■■■■□ 3
Kdm5dQ62240 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.79■■■■□ 3
Kdm5dQ62240 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.79■■■■□ 3
Kdm5dQ62240 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Kdm5dQ62240 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Kdm5dQ62240 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Kdm5dQ62240 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Kdm5dQ62240 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Kdm5dQ62240 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
Kdm5dQ62240 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
Kdm5dQ62240 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Kdm5dQ62240 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Kdm5dQ62240 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Kdm5dQ62240 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
Kdm5dQ62240 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
Kdm5dQ62240 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC33.76■■■■□ 3
Kdm5dQ62240 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.76■■■■□ 3
Kdm5dQ62240 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
Kdm5dQ62240 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC33.76■■■■□ 3
Kdm5dQ62240 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.76■■■■□ 3
Kdm5dQ62240 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.76■■■■□ 3
Kdm5dQ62240 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Kdm5dQ62240 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC33.76■■■□□ 2.99
Kdm5dQ62240 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Kdm5dQ62240 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
Kdm5dQ62240 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Kdm5dQ62240 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Kdm5dQ62240 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Kdm5dQ62240 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
Kdm5dQ62240 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Kdm5dQ62240 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC33.74■■■□□ 2.99
Kdm5dQ62240 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Kdm5dQ62240 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
Kdm5dQ62240 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Kdm5dQ62240 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
Kdm5dQ62240 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Kdm5dQ62240 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms