Protein–RNA interactions for Protein: Q62209

Sycp1, Synaptonemal complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp1Q62209 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sycp1Q62209 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sycp1Q62209 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Sycp1Q62209 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sycp1Q62209 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sycp1Q62209 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Sycp1Q62209 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sycp1Q62209 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sycp1Q62209 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sycp1Q62209 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sycp1Q62209 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sycp1Q62209 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sycp1Q62209 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sycp1Q62209 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sycp1Q62209 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sycp1Q62209 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sycp1Q62209 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sycp1Q62209 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sycp1Q62209 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sycp1Q62209 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sycp1Q62209 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sycp1Q62209 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sycp1Q62209 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sycp1Q62209 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sycp1Q62209 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sycp1Q62209 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sycp1Q62209 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sycp1Q62209 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sycp1Q62209 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Sycp1Q62209 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Sycp1Q62209 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sycp1Q62209 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sycp1Q62209 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sycp1Q62209 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Sycp1Q62209 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sycp1Q62209 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sycp1Q62209 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sycp1Q62209 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sycp1Q62209 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Sycp1Q62209 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sycp1Q62209 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sycp1Q62209 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sycp1Q62209 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sycp1Q62209 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sycp1Q62209 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sycp1Q62209 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sycp1Q62209 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sycp1Q62209 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sycp1Q62209 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sycp1Q62209 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sycp1Q62209 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sycp1Q62209 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sycp1Q62209 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sycp1Q62209 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sycp1Q62209 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sycp1Q62209 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sycp1Q62209 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sycp1Q62209 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sycp1Q62209 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sycp1Q62209 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sycp1Q62209 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sycp1Q62209 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sycp1Q62209 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sycp1Q62209 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sycp1Q62209 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sycp1Q62209 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sycp1Q62209 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sycp1Q62209 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Sycp1Q62209 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sycp1Q62209 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sycp1Q62209 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sycp1Q62209 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sycp1Q62209 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sycp1Q62209 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sycp1Q62209 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sycp1Q62209 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sycp1Q62209 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sycp1Q62209 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sycp1Q62209 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sycp1Q62209 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sycp1Q62209 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Sycp1Q62209 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sycp1Q62209 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sycp1Q62209 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sycp1Q62209 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sycp1Q62209 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sycp1Q62209 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sycp1Q62209 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sycp1Q62209 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sycp1Q62209 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sycp1Q62209 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sycp1Q62209 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sycp1Q62209 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sycp1Q62209 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sycp1Q62209 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sycp1Q62209 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sycp1Q62209 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sycp1Q62209 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sycp1Q62209 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sycp1Q62209 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms