Protein–RNA interactions for Protein: Q62186

Ssr4, Translocon-associated protein subunit delta, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssr4Q62186 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ssr4Q62186 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ssr4Q62186 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ssr4Q62186 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Ssr4Q62186 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ssr4Q62186 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ssr4Q62186 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ssr4Q62186 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ssr4Q62186 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ssr4Q62186 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ssr4Q62186 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ssr4Q62186 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ssr4Q62186 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ssr4Q62186 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ssr4Q62186 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ssr4Q62186 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ssr4Q62186 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ssr4Q62186 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ssr4Q62186 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ssr4Q62186 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ssr4Q62186 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ssr4Q62186 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ssr4Q62186 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ssr4Q62186 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ssr4Q62186 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ssr4Q62186 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ssr4Q62186 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ssr4Q62186 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ssr4Q62186 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Ssr4Q62186 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ssr4Q62186 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ssr4Q62186 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ssr4Q62186 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ssr4Q62186 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ssr4Q62186 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ssr4Q62186 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ssr4Q62186 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ssr4Q62186 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ssr4Q62186 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Ssr4Q62186 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ssr4Q62186 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ssr4Q62186 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ssr4Q62186 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ssr4Q62186 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ssr4Q62186 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ssr4Q62186 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ssr4Q62186 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ssr4Q62186 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ssr4Q62186 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ssr4Q62186 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ssr4Q62186 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ssr4Q62186 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ssr4Q62186 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ssr4Q62186 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Ssr4Q62186 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ssr4Q62186 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ssr4Q62186 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ssr4Q62186 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ssr4Q62186 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ssr4Q62186 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ssr4Q62186 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ssr4Q62186 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Ssr4Q62186 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ssr4Q62186 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ssr4Q62186 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ssr4Q62186 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ssr4Q62186 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ssr4Q62186 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ssr4Q62186 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ssr4Q62186 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ssr4Q62186 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ssr4Q62186 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Ssr4Q62186 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ssr4Q62186 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ssr4Q62186 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ssr4Q62186 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ssr4Q62186 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ssr4Q62186 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ssr4Q62186 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ssr4Q62186 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ssr4Q62186 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ssr4Q62186 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ssr4Q62186 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ssr4Q62186 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ssr4Q62186 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ssr4Q62186 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ssr4Q62186 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ssr4Q62186 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ssr4Q62186 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ssr4Q62186 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ssr4Q62186 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ssr4Q62186 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ssr4Q62186 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ssr4Q62186 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ssr4Q62186 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ssr4Q62186 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ssr4Q62186 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ssr4Q62186 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ssr4Q62186 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ssr4Q62186 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms