Protein–RNA interactions for Protein: Q62158

Trim27, Zinc finger protein RFP, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim27Q62158 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim27Q62158 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim27Q62158 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim27Q62158 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim27Q62158 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim27Q62158 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim27Q62158 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim27Q62158 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim27Q62158 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim27Q62158 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim27Q62158 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim27Q62158 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim27Q62158 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim27Q62158 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim27Q62158 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim27Q62158 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim27Q62158 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim27Q62158 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim27Q62158 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim27Q62158 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim27Q62158 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Trim27Q62158 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Trim27Q62158 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Trim27Q62158 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Trim27Q62158 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim27Q62158 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim27Q62158 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim27Q62158 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim27Q62158 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim27Q62158 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim27Q62158 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim27Q62158 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim27Q62158 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim27Q62158 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim27Q62158 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim27Q62158 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim27Q62158 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim27Q62158 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim27Q62158 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim27Q62158 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim27Q62158 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim27Q62158 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim27Q62158 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim27Q62158 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim27Q62158 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim27Q62158 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim27Q62158 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim27Q62158 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim27Q62158 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim27Q62158 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim27Q62158 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim27Q62158 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim27Q62158 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim27Q62158 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim27Q62158 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim27Q62158 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim27Q62158 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim27Q62158 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim27Q62158 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim27Q62158 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim27Q62158 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim27Q62158 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim27Q62158 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim27Q62158 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim27Q62158 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim27Q62158 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim27Q62158 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim27Q62158 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim27Q62158 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim27Q62158 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim27Q62158 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim27Q62158 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim27Q62158 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim27Q62158 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim27Q62158 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim27Q62158 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim27Q62158 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim27Q62158 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim27Q62158 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim27Q62158 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim27Q62158 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim27Q62158 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim27Q62158 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim27Q62158 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim27Q62158 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim27Q62158 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim27Q62158 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim27Q62158 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim27Q62158 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim27Q62158 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim27Q62158 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim27Q62158 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim27Q62158 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim27Q62158 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim27Q62158 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim27Q62158 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim27Q62158 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim27Q62158 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Trim27Q62158 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Trim27Q62158 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
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