Protein–RNA interactions for Protein: Q62066

Phox2a, Paired mesoderm homeobox protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phox2aQ62066 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Phox2aQ62066 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Phox2aQ62066 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Phox2aQ62066 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Phox2aQ62066 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Phox2aQ62066 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Phox2aQ62066 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Phox2aQ62066 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Phox2aQ62066 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Phox2aQ62066 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Phox2aQ62066 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Phox2aQ62066 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Phox2aQ62066 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Phox2aQ62066 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Phox2aQ62066 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Phox2aQ62066 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Phox2aQ62066 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Phox2aQ62066 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Phox2aQ62066 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Phox2aQ62066 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Phox2aQ62066 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Phox2aQ62066 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Phox2aQ62066 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Phox2aQ62066 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Phox2aQ62066 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Phox2aQ62066 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Phox2aQ62066 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Phox2aQ62066 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Phox2aQ62066 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Phox2aQ62066 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Phox2aQ62066 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Phox2aQ62066 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Phox2aQ62066 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Phox2aQ62066 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Phox2aQ62066 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Phox2aQ62066 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Phox2aQ62066 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Phox2aQ62066 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Phox2aQ62066 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Phox2aQ62066 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Phox2aQ62066 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Phox2aQ62066 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Phox2aQ62066 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Phox2aQ62066 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Phox2aQ62066 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Phox2aQ62066 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Phox2aQ62066 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Phox2aQ62066 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Phox2aQ62066 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Phox2aQ62066 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Phox2aQ62066 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Phox2aQ62066 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Phox2aQ62066 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Phox2aQ62066 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Phox2aQ62066 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Phox2aQ62066 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Phox2aQ62066 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Phox2aQ62066 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Phox2aQ62066 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Phox2aQ62066 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Phox2aQ62066 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Phox2aQ62066 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Phox2aQ62066 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Phox2aQ62066 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Phox2aQ62066 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Phox2aQ62066 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Phox2aQ62066 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Phox2aQ62066 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Phox2aQ62066 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Phox2aQ62066 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Phox2aQ62066 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Phox2aQ62066 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Phox2aQ62066 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Phox2aQ62066 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Phox2aQ62066 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Phox2aQ62066 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Phox2aQ62066 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Phox2aQ62066 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Phox2aQ62066 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Phox2aQ62066 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Phox2aQ62066 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Phox2aQ62066 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Phox2aQ62066 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Phox2aQ62066 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Phox2aQ62066 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Phox2aQ62066 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Phox2aQ62066 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Phox2aQ62066 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Phox2aQ62066 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Phox2aQ62066 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Phox2aQ62066 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Phox2aQ62066 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Phox2aQ62066 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Phox2aQ62066 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Phox2aQ62066 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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