Protein–RNA interactions for Protein: Q61602

Gli3, Transcriptional activator GLI3, mousemouse

Predictions only

Length 1,583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli3Q61602 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gli3Q61602 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gli3Q61602 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gli3Q61602 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gli3Q61602 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gli3Q61602 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gli3Q61602 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gli3Q61602 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gli3Q61602 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gli3Q61602 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gli3Q61602 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gli3Q61602 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gli3Q61602 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gli3Q61602 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Gli3Q61602 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gli3Q61602 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gli3Q61602 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gli3Q61602 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gli3Q61602 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gli3Q61602 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gli3Q61602 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gli3Q61602 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gli3Q61602 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
Gli3Q61602 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Gli3Q61602 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Gli3Q61602 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Gli3Q61602 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Gli3Q61602 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gli3Q61602 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gli3Q61602 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Gli3Q61602 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Gli3Q61602 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gli3Q61602 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Gli3Q61602 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gli3Q61602 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gli3Q61602 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gli3Q61602 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gli3Q61602 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gli3Q61602 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gli3Q61602 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gli3Q61602 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gli3Q61602 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gli3Q61602 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gli3Q61602 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gli3Q61602 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gli3Q61602 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gli3Q61602 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gli3Q61602 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gli3Q61602 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gli3Q61602 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gli3Q61602 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gli3Q61602 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Gli3Q61602 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gli3Q61602 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gli3Q61602 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gli3Q61602 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gli3Q61602 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Gli3Q61602 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Gli3Q61602 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gli3Q61602 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gli3Q61602 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gli3Q61602 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gli3Q61602 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gli3Q61602 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gli3Q61602 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gli3Q61602 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gli3Q61602 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gli3Q61602 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gli3Q61602 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gli3Q61602 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gli3Q61602 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gli3Q61602 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Gli3Q61602 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gli3Q61602 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gli3Q61602 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gli3Q61602 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gli3Q61602 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gli3Q61602 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gli3Q61602 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gli3Q61602 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gli3Q61602 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gli3Q61602 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gli3Q61602 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gli3Q61602 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gli3Q61602 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Gli3Q61602 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gli3Q61602 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gli3Q61602 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gli3Q61602 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gli3Q61602 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Gli3Q61602 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Gli3Q61602 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gli3Q61602 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gli3Q61602 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gli3Q61602 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gli3Q61602 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Gli3Q61602 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gli3Q61602 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gli3Q61602 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gli3Q61602 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms