Protein–RNA interactions for Protein: Q61450

Gp49a, Mast cell surface glycoprotein Gp49A, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp49aQ61450 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gp49aQ61450 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gp49aQ61450 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gp49aQ61450 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gp49aQ61450 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gp49aQ61450 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gp49aQ61450 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gp49aQ61450 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gp49aQ61450 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gp49aQ61450 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gp49aQ61450 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gp49aQ61450 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gp49aQ61450 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gp49aQ61450 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gp49aQ61450 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gp49aQ61450 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gp49aQ61450 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gp49aQ61450 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gp49aQ61450 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gp49aQ61450 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gp49aQ61450 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gp49aQ61450 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gp49aQ61450 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gp49aQ61450 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gp49aQ61450 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gp49aQ61450 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gp49aQ61450 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gp49aQ61450 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gp49aQ61450 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gp49aQ61450 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gp49aQ61450 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gp49aQ61450 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gp49aQ61450 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gp49aQ61450 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gp49aQ61450 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gp49aQ61450 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gp49aQ61450 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gp49aQ61450 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gp49aQ61450 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gp49aQ61450 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gp49aQ61450 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gp49aQ61450 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gp49aQ61450 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gp49aQ61450 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gp49aQ61450 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gp49aQ61450 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gp49aQ61450 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gp49aQ61450 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gp49aQ61450 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gp49aQ61450 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gp49aQ61450 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gp49aQ61450 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gp49aQ61450 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gp49aQ61450 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gp49aQ61450 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gp49aQ61450 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gp49aQ61450 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gp49aQ61450 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gp49aQ61450 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gp49aQ61450 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gp49aQ61450 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gp49aQ61450 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gp49aQ61450 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gp49aQ61450 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gp49aQ61450 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gp49aQ61450 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gp49aQ61450 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gp49aQ61450 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gp49aQ61450 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gp49aQ61450 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gp49aQ61450 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gp49aQ61450 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gp49aQ61450 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gp49aQ61450 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gp49aQ61450 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gp49aQ61450 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gp49aQ61450 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gp49aQ61450 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gp49aQ61450 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gp49aQ61450 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gp49aQ61450 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gp49aQ61450 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gp49aQ61450 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gp49aQ61450 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gp49aQ61450 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gp49aQ61450 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gp49aQ61450 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gp49aQ61450 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gp49aQ61450 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gp49aQ61450 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gp49aQ61450 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gp49aQ61450 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gp49aQ61450 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gp49aQ61450 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gp49aQ61450 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gp49aQ61450 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gp49aQ61450 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gp49aQ61450 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gp49aQ61450 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gp49aQ61450 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms