Protein–RNA interactions for Protein: Q61409

Pde3b, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, mousemouse

Predictions only

Length 1,100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde3bQ61409 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pde3bQ61409 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pde3bQ61409 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pde3bQ61409 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pde3bQ61409 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pde3bQ61409 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pde3bQ61409 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pde3bQ61409 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pde3bQ61409 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pde3bQ61409 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pde3bQ61409 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pde3bQ61409 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pde3bQ61409 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pde3bQ61409 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pde3bQ61409 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pde3bQ61409 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pde3bQ61409 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pde3bQ61409 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pde3bQ61409 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pde3bQ61409 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pde3bQ61409 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pde3bQ61409 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Pde3bQ61409 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pde3bQ61409 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pde3bQ61409 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pde3bQ61409 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pde3bQ61409 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pde3bQ61409 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pde3bQ61409 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pde3bQ61409 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pde3bQ61409 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pde3bQ61409 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pde3bQ61409 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pde3bQ61409 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Pde3bQ61409 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pde3bQ61409 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pde3bQ61409 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pde3bQ61409 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pde3bQ61409 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Pde3bQ61409 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Pde3bQ61409 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Pde3bQ61409 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Pde3bQ61409 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pde3bQ61409 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pde3bQ61409 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pde3bQ61409 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pde3bQ61409 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pde3bQ61409 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Pde3bQ61409 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pde3bQ61409 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pde3bQ61409 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pde3bQ61409 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pde3bQ61409 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pde3bQ61409 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pde3bQ61409 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pde3bQ61409 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pde3bQ61409 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pde3bQ61409 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pde3bQ61409 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Pde3bQ61409 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Pde3bQ61409 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Pde3bQ61409 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pde3bQ61409 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pde3bQ61409 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pde3bQ61409 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pde3bQ61409 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pde3bQ61409 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pde3bQ61409 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pde3bQ61409 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pde3bQ61409 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pde3bQ61409 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pde3bQ61409 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pde3bQ61409 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pde3bQ61409 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pde3bQ61409 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pde3bQ61409 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pde3bQ61409 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pde3bQ61409 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pde3bQ61409 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pde3bQ61409 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pde3bQ61409 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pde3bQ61409 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pde3bQ61409 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pde3bQ61409 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pde3bQ61409 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pde3bQ61409 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pde3bQ61409 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pde3bQ61409 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pde3bQ61409 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pde3bQ61409 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pde3bQ61409 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pde3bQ61409 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pde3bQ61409 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pde3bQ61409 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pde3bQ61409 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pde3bQ61409 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pde3bQ61409 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pde3bQ61409 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pde3bQ61409 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pde3bQ61409 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms