Protein–RNA interactions for Protein: Q61285

Abcd2, ATP-binding cassette sub-family D member 2, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd2Q61285 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Abcd2Q61285 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Abcd2Q61285 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Abcd2Q61285 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Abcd2Q61285 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Abcd2Q61285 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Abcd2Q61285 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Abcd2Q61285 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Abcd2Q61285 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Abcd2Q61285 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Abcd2Q61285 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Abcd2Q61285 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Abcd2Q61285 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Abcd2Q61285 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Abcd2Q61285 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Abcd2Q61285 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Abcd2Q61285 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Abcd2Q61285 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Abcd2Q61285 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Abcd2Q61285 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Abcd2Q61285 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Abcd2Q61285 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Abcd2Q61285 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Abcd2Q61285 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Abcd2Q61285 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Abcd2Q61285 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Abcd2Q61285 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Abcd2Q61285 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Abcd2Q61285 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Abcd2Q61285 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Abcd2Q61285 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Abcd2Q61285 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Abcd2Q61285 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Abcd2Q61285 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Abcd2Q61285 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Abcd2Q61285 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Abcd2Q61285 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Abcd2Q61285 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Abcd2Q61285 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Abcd2Q61285 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Abcd2Q61285 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Abcd2Q61285 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Abcd2Q61285 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Abcd2Q61285 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Abcd2Q61285 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Abcd2Q61285 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Abcd2Q61285 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Abcd2Q61285 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Abcd2Q61285 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Abcd2Q61285 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Abcd2Q61285 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Abcd2Q61285 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Abcd2Q61285 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Abcd2Q61285 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Abcd2Q61285 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Abcd2Q61285 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Abcd2Q61285 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Abcd2Q61285 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Abcd2Q61285 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Abcd2Q61285 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Abcd2Q61285 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Abcd2Q61285 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Abcd2Q61285 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Abcd2Q61285 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Abcd2Q61285 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Abcd2Q61285 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Abcd2Q61285 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Abcd2Q61285 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Abcd2Q61285 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Abcd2Q61285 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Abcd2Q61285 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Abcd2Q61285 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Abcd2Q61285 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Abcd2Q61285 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Abcd2Q61285 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Abcd2Q61285 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Abcd2Q61285 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Abcd2Q61285 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Abcd2Q61285 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Abcd2Q61285 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Abcd2Q61285 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Abcd2Q61285 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Abcd2Q61285 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Abcd2Q61285 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Abcd2Q61285 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Abcd2Q61285 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Abcd2Q61285 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Abcd2Q61285 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Abcd2Q61285 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Abcd2Q61285 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Abcd2Q61285 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Abcd2Q61285 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Abcd2Q61285 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Abcd2Q61285 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Abcd2Q61285 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Abcd2Q61285 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Abcd2Q61285 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Abcd2Q61285 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Abcd2Q61285 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Abcd2Q61285 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.1 ms