Protein–RNA interactions for Protein: Q61080

Foxf1, Forkhead box protein F1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxf1Q61080 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Foxf1Q61080 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Foxf1Q61080 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Foxf1Q61080 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Foxf1Q61080 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Foxf1Q61080 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Foxf1Q61080 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Foxf1Q61080 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Foxf1Q61080 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Foxf1Q61080 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Foxf1Q61080 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Foxf1Q61080 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Foxf1Q61080 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Foxf1Q61080 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Foxf1Q61080 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Foxf1Q61080 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Foxf1Q61080 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Foxf1Q61080 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Foxf1Q61080 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Foxf1Q61080 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Foxf1Q61080 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Foxf1Q61080 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Foxf1Q61080 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Foxf1Q61080 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Foxf1Q61080 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Foxf1Q61080 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Foxf1Q61080 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Foxf1Q61080 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Foxf1Q61080 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Foxf1Q61080 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Foxf1Q61080 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Foxf1Q61080 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Foxf1Q61080 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Foxf1Q61080 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ 0
Foxf1Q61080 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Foxf1Q61080 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Foxf1Q61080 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Foxf1Q61080 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Foxf1Q61080 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Foxf1Q61080 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Foxf1Q61080 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Foxf1Q61080 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Foxf1Q61080 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Foxf1Q61080 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Foxf1Q61080 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Foxf1Q61080 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Foxf1Q61080 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Foxf1Q61080 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Foxf1Q61080 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Foxf1Q61080 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Foxf1Q61080 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Foxf1Q61080 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Foxf1Q61080 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Foxf1Q61080 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Foxf1Q61080 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Foxf1Q61080 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Foxf1Q61080 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Foxf1Q61080 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Foxf1Q61080 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Foxf1Q61080 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Foxf1Q61080 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Foxf1Q61080 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Foxf1Q61080 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Foxf1Q61080 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Foxf1Q61080 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Foxf1Q61080 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Foxf1Q61080 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Foxf1Q61080 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Foxf1Q61080 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Foxf1Q61080 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Foxf1Q61080 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Foxf1Q61080 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Foxf1Q61080 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Foxf1Q61080 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Foxf1Q61080 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Foxf1Q61080 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Foxf1Q61080 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Foxf1Q61080 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Foxf1Q61080 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Foxf1Q61080 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Foxf1Q61080 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Foxf1Q61080 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Foxf1Q61080 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Foxf1Q61080 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Foxf1Q61080 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Foxf1Q61080 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Foxf1Q61080 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Foxf1Q61080 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Foxf1Q61080 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Foxf1Q61080 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Foxf1Q61080 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Foxf1Q61080 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Foxf1Q61080 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Foxf1Q61080 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Foxf1Q61080 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Foxf1Q61080 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Foxf1Q61080 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Foxf1Q61080 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Foxf1Q61080 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Foxf1Q61080 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms