Protein–RNA interactions for Protein: Q60987

Foxg1, Forkhead box protein G1, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxg1Q60987 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Foxg1Q60987 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Foxg1Q60987 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Foxg1Q60987 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Foxg1Q60987 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Foxg1Q60987 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Foxg1Q60987 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Foxg1Q60987 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Foxg1Q60987 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Foxg1Q60987 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Foxg1Q60987 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Foxg1Q60987 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Foxg1Q60987 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Foxg1Q60987 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Foxg1Q60987 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Foxg1Q60987 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Foxg1Q60987 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Foxg1Q60987 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Foxg1Q60987 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Foxg1Q60987 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Foxg1Q60987 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Foxg1Q60987 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Foxg1Q60987 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Foxg1Q60987 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Foxg1Q60987 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Foxg1Q60987 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Foxg1Q60987 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Foxg1Q60987 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Foxg1Q60987 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Foxg1Q60987 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Foxg1Q60987 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Foxg1Q60987 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Foxg1Q60987 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Foxg1Q60987 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Foxg1Q60987 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Foxg1Q60987 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Foxg1Q60987 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Foxg1Q60987 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Foxg1Q60987 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Foxg1Q60987 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Foxg1Q60987 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Foxg1Q60987 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Foxg1Q60987 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Foxg1Q60987 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Foxg1Q60987 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Foxg1Q60987 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Foxg1Q60987 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Foxg1Q60987 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Foxg1Q60987 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Foxg1Q60987 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Foxg1Q60987 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Foxg1Q60987 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Foxg1Q60987 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Foxg1Q60987 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Foxg1Q60987 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Foxg1Q60987 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Foxg1Q60987 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Foxg1Q60987 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Foxg1Q60987 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Foxg1Q60987 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Foxg1Q60987 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Foxg1Q60987 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Foxg1Q60987 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Foxg1Q60987 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Foxg1Q60987 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Foxg1Q60987 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Foxg1Q60987 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxg1Q60987 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxg1Q60987 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxg1Q60987 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxg1Q60987 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxg1Q60987 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxg1Q60987 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxg1Q60987 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxg1Q60987 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxg1Q60987 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxg1Q60987 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxg1Q60987 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxg1Q60987 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Foxg1Q60987 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxg1Q60987 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxg1Q60987 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxg1Q60987 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxg1Q60987 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxg1Q60987 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxg1Q60987 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxg1Q60987 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxg1Q60987 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxg1Q60987 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxg1Q60987 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxg1Q60987 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxg1Q60987 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxg1Q60987 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxg1Q60987 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxg1Q60987 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxg1Q60987 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxg1Q60987 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxg1Q60987 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxg1Q60987 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Foxg1Q60987 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms