Protein–RNA interactions for Protein: Q60960

Kpna1, Importin subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 538 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna1Q60960 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Kpna1Q60960 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Kpna1Q60960 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Kpna1Q60960 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Kpna1Q60960 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Kpna1Q60960 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Kpna1Q60960 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Kpna1Q60960 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Kpna1Q60960 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Kpna1Q60960 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Kpna1Q60960 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Kpna1Q60960 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Kpna1Q60960 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Kpna1Q60960 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Kpna1Q60960 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Kpna1Q60960 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Kpna1Q60960 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Kpna1Q60960 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Kpna1Q60960 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Kpna1Q60960 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Kpna1Q60960 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Kpna1Q60960 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Kpna1Q60960 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Kpna1Q60960 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Kpna1Q60960 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Kpna1Q60960 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Kpna1Q60960 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Kpna1Q60960 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Kpna1Q60960 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Kpna1Q60960 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Kpna1Q60960 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Kpna1Q60960 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Kpna1Q60960 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Kpna1Q60960 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Kpna1Q60960 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Kpna1Q60960 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Kpna1Q60960 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Kpna1Q60960 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Kpna1Q60960 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Kpna1Q60960 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Kpna1Q60960 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Kpna1Q60960 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Kpna1Q60960 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Kpna1Q60960 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Kpna1Q60960 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Kpna1Q60960 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Kpna1Q60960 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Kpna1Q60960 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Kpna1Q60960 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Kpna1Q60960 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Kpna1Q60960 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Kpna1Q60960 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Kpna1Q60960 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Kpna1Q60960 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Kpna1Q60960 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Kpna1Q60960 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Kpna1Q60960 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Kpna1Q60960 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Kpna1Q60960 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Kpna1Q60960 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Kpna1Q60960 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Kpna1Q60960 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Kpna1Q60960 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Kpna1Q60960 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Kpna1Q60960 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Kpna1Q60960 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Kpna1Q60960 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Kpna1Q60960 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Kpna1Q60960 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Kpna1Q60960 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Kpna1Q60960 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Kpna1Q60960 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Kpna1Q60960 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Kpna1Q60960 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Kpna1Q60960 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Kpna1Q60960 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Kpna1Q60960 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Kpna1Q60960 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Kpna1Q60960 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Kpna1Q60960 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Kpna1Q60960 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Kpna1Q60960 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Kpna1Q60960 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Kpna1Q60960 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Kpna1Q60960 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Kpna1Q60960 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Kpna1Q60960 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Kpna1Q60960 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Kpna1Q60960 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Kpna1Q60960 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Kpna1Q60960 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Kpna1Q60960 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Kpna1Q60960 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Kpna1Q60960 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Kpna1Q60960 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Kpna1Q60960 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Kpna1Q60960 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Kpna1Q60960 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Kpna1Q60960 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Kpna1Q60960 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.9 ms