Protein–RNA interactions for Protein: Q60954

Meis1, Homeobox protein Meis1, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Meis1Q60954 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Meis1Q60954 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Meis1Q60954 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Meis1Q60954 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Meis1Q60954 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Meis1Q60954 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Meis1Q60954 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Meis1Q60954 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Meis1Q60954 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Meis1Q60954 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Meis1Q60954 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Meis1Q60954 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Meis1Q60954 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Meis1Q60954 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Meis1Q60954 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Meis1Q60954 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Meis1Q60954 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Meis1Q60954 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Meis1Q60954 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Meis1Q60954 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Meis1Q60954 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Meis1Q60954 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Meis1Q60954 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Meis1Q60954 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Meis1Q60954 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Meis1Q60954 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Meis1Q60954 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Meis1Q60954 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Meis1Q60954 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Meis1Q60954 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Meis1Q60954 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Meis1Q60954 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Meis1Q60954 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Meis1Q60954 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Meis1Q60954 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Meis1Q60954 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Meis1Q60954 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Meis1Q60954 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
Meis1Q60954 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Meis1Q60954 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Meis1Q60954 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Meis1Q60954 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Meis1Q60954 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Meis1Q60954 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Meis1Q60954 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Meis1Q60954 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Meis1Q60954 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Meis1Q60954 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Meis1Q60954 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Meis1Q60954 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Meis1Q60954 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Meis1Q60954 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Meis1Q60954 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Meis1Q60954 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Meis1Q60954 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Meis1Q60954 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Meis1Q60954 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Meis1Q60954 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Meis1Q60954 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Meis1Q60954 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Meis1Q60954 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Meis1Q60954 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Meis1Q60954 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Meis1Q60954 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Meis1Q60954 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Meis1Q60954 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Meis1Q60954 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Meis1Q60954 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Meis1Q60954 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Meis1Q60954 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Meis1Q60954 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Meis1Q60954 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Meis1Q60954 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Meis1Q60954 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Meis1Q60954 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Meis1Q60954 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Meis1Q60954 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Meis1Q60954 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Meis1Q60954 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Meis1Q60954 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Meis1Q60954 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Meis1Q60954 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Meis1Q60954 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Meis1Q60954 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Meis1Q60954 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Meis1Q60954 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Meis1Q60954 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Meis1Q60954 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Meis1Q60954 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Meis1Q60954 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Meis1Q60954 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Meis1Q60954 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Meis1Q60954 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Meis1Q60954 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Meis1Q60954 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Meis1Q60954 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Meis1Q60954 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Meis1Q60954 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Meis1Q60954 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Meis1Q60954 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms