Protein–RNA interactions for Protein: Q60809

Cnot7, CCR4-NOT transcription complex subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot7Q60809 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cnot7Q60809 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Cnot7Q60809 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cnot7Q60809 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cnot7Q60809 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cnot7Q60809 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cnot7Q60809 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cnot7Q60809 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cnot7Q60809 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cnot7Q60809 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cnot7Q60809 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Cnot7Q60809 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cnot7Q60809 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cnot7Q60809 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cnot7Q60809 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cnot7Q60809 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cnot7Q60809 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cnot7Q60809 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cnot7Q60809 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Cnot7Q60809 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cnot7Q60809 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cnot7Q60809 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cnot7Q60809 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cnot7Q60809 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cnot7Q60809 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cnot7Q60809 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cnot7Q60809 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cnot7Q60809 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cnot7Q60809 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cnot7Q60809 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cnot7Q60809 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cnot7Q60809 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cnot7Q60809 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cnot7Q60809 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cnot7Q60809 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cnot7Q60809 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cnot7Q60809 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cnot7Q60809 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cnot7Q60809 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cnot7Q60809 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Cnot7Q60809 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cnot7Q60809 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cnot7Q60809 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cnot7Q60809 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cnot7Q60809 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cnot7Q60809 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cnot7Q60809 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cnot7Q60809 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cnot7Q60809 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cnot7Q60809 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cnot7Q60809 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cnot7Q60809 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cnot7Q60809 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cnot7Q60809 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Cnot7Q60809 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cnot7Q60809 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cnot7Q60809 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cnot7Q60809 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cnot7Q60809 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cnot7Q60809 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cnot7Q60809 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cnot7Q60809 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cnot7Q60809 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cnot7Q60809 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cnot7Q60809 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cnot7Q60809 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cnot7Q60809 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cnot7Q60809 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cnot7Q60809 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cnot7Q60809 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cnot7Q60809 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cnot7Q60809 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cnot7Q60809 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cnot7Q60809 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cnot7Q60809 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cnot7Q60809 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cnot7Q60809 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cnot7Q60809 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cnot7Q60809 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cnot7Q60809 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cnot7Q60809 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cnot7Q60809 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cnot7Q60809 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cnot7Q60809 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Cnot7Q60809 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cnot7Q60809 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cnot7Q60809 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cnot7Q60809 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cnot7Q60809 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cnot7Q60809 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cnot7Q60809 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cnot7Q60809 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cnot7Q60809 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cnot7Q60809 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cnot7Q60809 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cnot7Q60809 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cnot7Q60809 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cnot7Q60809 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cnot7Q60809 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cnot7Q60809 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms