Protein–RNA interactions for Protein: Q60803

Traf3, TNF receptor-associated factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3Q60803 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Traf3Q60803 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Traf3Q60803 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Traf3Q60803 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Traf3Q60803 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Traf3Q60803 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Traf3Q60803 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Traf3Q60803 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Traf3Q60803 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Traf3Q60803 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Traf3Q60803 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Traf3Q60803 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Traf3Q60803 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Traf3Q60803 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Traf3Q60803 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Traf3Q60803 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Traf3Q60803 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Traf3Q60803 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Traf3Q60803 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Traf3Q60803 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Traf3Q60803 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Traf3Q60803 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Traf3Q60803 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Traf3Q60803 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Traf3Q60803 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Traf3Q60803 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Traf3Q60803 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Traf3Q60803 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Traf3Q60803 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Traf3Q60803 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Traf3Q60803 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Traf3Q60803 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Traf3Q60803 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Traf3Q60803 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Traf3Q60803 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Traf3Q60803 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Traf3Q60803 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Traf3Q60803 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Traf3Q60803 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Traf3Q60803 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Traf3Q60803 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Traf3Q60803 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Traf3Q60803 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Traf3Q60803 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Traf3Q60803 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Traf3Q60803 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Traf3Q60803 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Traf3Q60803 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Traf3Q60803 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Traf3Q60803 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Traf3Q60803 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Traf3Q60803 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Traf3Q60803 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Traf3Q60803 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Traf3Q60803 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Traf3Q60803 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Traf3Q60803 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Traf3Q60803 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Traf3Q60803 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Traf3Q60803 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Traf3Q60803 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Traf3Q60803 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Traf3Q60803 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Traf3Q60803 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Traf3Q60803 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Traf3Q60803 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Traf3Q60803 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Traf3Q60803 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Traf3Q60803 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Traf3Q60803 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Traf3Q60803 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Traf3Q60803 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Traf3Q60803 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Traf3Q60803 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Traf3Q60803 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Traf3Q60803 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Traf3Q60803 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Traf3Q60803 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Traf3Q60803 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Traf3Q60803 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Traf3Q60803 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Traf3Q60803 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Traf3Q60803 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Traf3Q60803 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Traf3Q60803 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Traf3Q60803 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Traf3Q60803 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Traf3Q60803 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Traf3Q60803 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Traf3Q60803 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Traf3Q60803 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Traf3Q60803 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Traf3Q60803 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Traf3Q60803 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Traf3Q60803 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Traf3Q60803 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Traf3Q60803 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Traf3Q60803 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Traf3Q60803 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Traf3Q60803 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms