Protein–RNA interactions for Protein: Q60793

Klf4, Krueppel-like factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf4Q60793 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Klf4Q60793 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Klf4Q60793 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Klf4Q60793 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Klf4Q60793 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Klf4Q60793 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Klf4Q60793 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Klf4Q60793 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Klf4Q60793 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Klf4Q60793 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Klf4Q60793 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Klf4Q60793 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Klf4Q60793 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Klf4Q60793 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Klf4Q60793 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Klf4Q60793 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Klf4Q60793 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Klf4Q60793 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Klf4Q60793 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Klf4Q60793 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Klf4Q60793 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Klf4Q60793 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Klf4Q60793 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Klf4Q60793 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Klf4Q60793 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Klf4Q60793 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Klf4Q60793 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Klf4Q60793 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Klf4Q60793 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Klf4Q60793 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Klf4Q60793 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Klf4Q60793 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Klf4Q60793 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Klf4Q60793 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Klf4Q60793 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Klf4Q60793 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Klf4Q60793 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Klf4Q60793 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Klf4Q60793 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Klf4Q60793 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Klf4Q60793 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Klf4Q60793 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Klf4Q60793 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Klf4Q60793 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Klf4Q60793 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Klf4Q60793 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Klf4Q60793 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Klf4Q60793 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Klf4Q60793 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Klf4Q60793 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Klf4Q60793 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Klf4Q60793 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Klf4Q60793 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Klf4Q60793 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Klf4Q60793 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Klf4Q60793 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Klf4Q60793 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Klf4Q60793 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Klf4Q60793 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Klf4Q60793 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Klf4Q60793 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Klf4Q60793 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Klf4Q60793 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Klf4Q60793 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Klf4Q60793 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Klf4Q60793 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Klf4Q60793 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Klf4Q60793 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Klf4Q60793 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Klf4Q60793 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Klf4Q60793 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Klf4Q60793 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Klf4Q60793 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Klf4Q60793 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Klf4Q60793 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Klf4Q60793 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Klf4Q60793 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Klf4Q60793 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Klf4Q60793 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Klf4Q60793 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Klf4Q60793 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Klf4Q60793 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Klf4Q60793 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Klf4Q60793 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Klf4Q60793 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Klf4Q60793 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Klf4Q60793 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Klf4Q60793 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Klf4Q60793 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Klf4Q60793 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Klf4Q60793 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Klf4Q60793 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Klf4Q60793 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Klf4Q60793 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Klf4Q60793 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Klf4Q60793 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Klf4Q60793 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Klf4Q60793 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Klf4Q60793 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Klf4Q60793 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms