Protein–RNA interactions for Protein: Q60772

Cdkn2c, Cyclin-dependent kinase 4 inhibitor C, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn2cQ60772 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cdkn2cQ60772 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cdkn2cQ60772 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cdkn2cQ60772 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cdkn2cQ60772 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cdkn2cQ60772 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cdkn2cQ60772 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Cdkn2cQ60772 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cdkn2cQ60772 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cdkn2cQ60772 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cdkn2cQ60772 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cdkn2cQ60772 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cdkn2cQ60772 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cdkn2cQ60772 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cdkn2cQ60772 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cdkn2cQ60772 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cdkn2cQ60772 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Cdkn2cQ60772 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cdkn2cQ60772 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cdkn2cQ60772 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cdkn2cQ60772 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cdkn2cQ60772 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cdkn2cQ60772 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cdkn2cQ60772 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cdkn2cQ60772 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cdkn2cQ60772 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cdkn2cQ60772 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cdkn2cQ60772 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cdkn2cQ60772 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cdkn2cQ60772 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cdkn2cQ60772 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cdkn2cQ60772 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cdkn2cQ60772 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cdkn2cQ60772 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cdkn2cQ60772 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cdkn2cQ60772 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cdkn2cQ60772 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cdkn2cQ60772 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cdkn2cQ60772 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cdkn2cQ60772 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cdkn2cQ60772 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cdkn2cQ60772 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cdkn2cQ60772 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Cdkn2cQ60772 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cdkn2cQ60772 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cdkn2cQ60772 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cdkn2cQ60772 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cdkn2cQ60772 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cdkn2cQ60772 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cdkn2cQ60772 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cdkn2cQ60772 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cdkn2cQ60772 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cdkn2cQ60772 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cdkn2cQ60772 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cdkn2cQ60772 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cdkn2cQ60772 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cdkn2cQ60772 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cdkn2cQ60772 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Cdkn2cQ60772 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cdkn2cQ60772 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cdkn2cQ60772 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cdkn2cQ60772 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cdkn2cQ60772 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cdkn2cQ60772 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cdkn2cQ60772 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cdkn2cQ60772 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cdkn2cQ60772 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cdkn2cQ60772 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Cdkn2cQ60772 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cdkn2cQ60772 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Cdkn2cQ60772 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cdkn2cQ60772 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cdkn2cQ60772 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cdkn2cQ60772 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Cdkn2cQ60772 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cdkn2cQ60772 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cdkn2cQ60772 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cdkn2cQ60772 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cdkn2cQ60772 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cdkn2cQ60772 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cdkn2cQ60772 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cdkn2cQ60772 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cdkn2cQ60772 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cdkn2cQ60772 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cdkn2cQ60772 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cdkn2cQ60772 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cdkn2cQ60772 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cdkn2cQ60772 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cdkn2cQ60772 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cdkn2cQ60772 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cdkn2cQ60772 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cdkn2cQ60772 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cdkn2cQ60772 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cdkn2cQ60772 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cdkn2cQ60772 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cdkn2cQ60772 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cdkn2cQ60772 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cdkn2cQ60772 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cdkn2cQ60772 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cdkn2cQ60772 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms