Protein–RNA interactions for Protein: Q60673

Ptprn, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprnQ60673 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
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PtprnQ60673 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PtprnQ60673 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PtprnQ60673 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PtprnQ60673 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PtprnQ60673 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PtprnQ60673 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
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PtprnQ60673 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PtprnQ60673 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PtprnQ60673 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PtprnQ60673 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PtprnQ60673 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PtprnQ60673 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PtprnQ60673 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PtprnQ60673 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
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PtprnQ60673 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PtprnQ60673 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PtprnQ60673 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PtprnQ60673 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PtprnQ60673 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PtprnQ60673 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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PtprnQ60673 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PtprnQ60673 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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PtprnQ60673 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PtprnQ60673 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
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PtprnQ60673 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PtprnQ60673 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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PtprnQ60673 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PtprnQ60673 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PtprnQ60673 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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PtprnQ60673 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
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PtprnQ60673 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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PtprnQ60673 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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PtprnQ60673 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PtprnQ60673 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
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PtprnQ60673 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
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PtprnQ60673 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PtprnQ60673 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
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PtprnQ60673 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtprnQ60673 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtprnQ60673 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtprnQ60673 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtprnQ60673 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtprnQ60673 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtprnQ60673 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
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PtprnQ60673 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PtprnQ60673 Gm42790-201ENSMUST00000201268 969 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PtprnQ60673 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtprnQ60673 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtprnQ60673 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtprnQ60673 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PtprnQ60673 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PtprnQ60673 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PtprnQ60673 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
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