Protein–RNA interactions for Protein: Q5XF89

Atp13a3, Probable cation-transporting ATPase 13A3, mousemouse

Predictions only

Length 1,219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a3Q5XF89 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atp13a3Q5XF89 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atp13a3Q5XF89 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Atp13a3Q5XF89 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atp13a3Q5XF89 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atp13a3Q5XF89 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Atp13a3Q5XF89 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atp13a3Q5XF89 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atp13a3Q5XF89 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atp13a3Q5XF89 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atp13a3Q5XF89 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atp13a3Q5XF89 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atp13a3Q5XF89 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atp13a3Q5XF89 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atp13a3Q5XF89 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atp13a3Q5XF89 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atp13a3Q5XF89 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atp13a3Q5XF89 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atp13a3Q5XF89 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Atp13a3Q5XF89 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atp13a3Q5XF89 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atp13a3Q5XF89 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atp13a3Q5XF89 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atp13a3Q5XF89 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Atp13a3Q5XF89 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Atp13a3Q5XF89 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Atp13a3Q5XF89 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Atp13a3Q5XF89 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Atp13a3Q5XF89 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Atp13a3Q5XF89 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Atp13a3Q5XF89 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Atp13a3Q5XF89 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Atp13a3Q5XF89 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atp13a3Q5XF89 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atp13a3Q5XF89 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atp13a3Q5XF89 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atp13a3Q5XF89 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Atp13a3Q5XF89 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Atp13a3Q5XF89 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atp13a3Q5XF89 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atp13a3Q5XF89 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atp13a3Q5XF89 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atp13a3Q5XF89 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Atp13a3Q5XF89 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atp13a3Q5XF89 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atp13a3Q5XF89 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atp13a3Q5XF89 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atp13a3Q5XF89 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atp13a3Q5XF89 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atp13a3Q5XF89 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atp13a3Q5XF89 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atp13a3Q5XF89 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atp13a3Q5XF89 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atp13a3Q5XF89 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atp13a3Q5XF89 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atp13a3Q5XF89 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atp13a3Q5XF89 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atp13a3Q5XF89 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atp13a3Q5XF89 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atp13a3Q5XF89 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atp13a3Q5XF89 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atp13a3Q5XF89 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atp13a3Q5XF89 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atp13a3Q5XF89 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atp13a3Q5XF89 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atp13a3Q5XF89 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atp13a3Q5XF89 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atp13a3Q5XF89 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Atp13a3Q5XF89 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Atp13a3Q5XF89 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Atp13a3Q5XF89 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atp13a3Q5XF89 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atp13a3Q5XF89 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Atp13a3Q5XF89 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atp13a3Q5XF89 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atp13a3Q5XF89 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atp13a3Q5XF89 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atp13a3Q5XF89 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atp13a3Q5XF89 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atp13a3Q5XF89 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atp13a3Q5XF89 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atp13a3Q5XF89 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atp13a3Q5XF89 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atp13a3Q5XF89 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atp13a3Q5XF89 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atp13a3Q5XF89 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atp13a3Q5XF89 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Atp13a3Q5XF89 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atp13a3Q5XF89 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atp13a3Q5XF89 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Atp13a3Q5XF89 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atp13a3Q5XF89 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atp13a3Q5XF89 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atp13a3Q5XF89 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atp13a3Q5XF89 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atp13a3Q5XF89 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atp13a3Q5XF89 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atp13a3Q5XF89 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atp13a3Q5XF89 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atp13a3Q5XF89 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms