Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZ99

Trim38, Tripartite motif-containing 38, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim38Q5SZ99 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trim38Q5SZ99 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trim38Q5SZ99 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trim38Q5SZ99 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trim38Q5SZ99 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trim38Q5SZ99 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trim38Q5SZ99 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trim38Q5SZ99 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trim38Q5SZ99 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trim38Q5SZ99 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trim38Q5SZ99 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trim38Q5SZ99 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trim38Q5SZ99 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trim38Q5SZ99 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trim38Q5SZ99 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trim38Q5SZ99 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trim38Q5SZ99 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Trim38Q5SZ99 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Trim38Q5SZ99 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trim38Q5SZ99 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trim38Q5SZ99 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Trim38Q5SZ99 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trim38Q5SZ99 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Trim38Q5SZ99 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trim38Q5SZ99 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trim38Q5SZ99 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trim38Q5SZ99 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trim38Q5SZ99 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trim38Q5SZ99 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Trim38Q5SZ99 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trim38Q5SZ99 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trim38Q5SZ99 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trim38Q5SZ99 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trim38Q5SZ99 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trim38Q5SZ99 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trim38Q5SZ99 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trim38Q5SZ99 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trim38Q5SZ99 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trim38Q5SZ99 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trim38Q5SZ99 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trim38Q5SZ99 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trim38Q5SZ99 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trim38Q5SZ99 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trim38Q5SZ99 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trim38Q5SZ99 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trim38Q5SZ99 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trim38Q5SZ99 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trim38Q5SZ99 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trim38Q5SZ99 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trim38Q5SZ99 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trim38Q5SZ99 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trim38Q5SZ99 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trim38Q5SZ99 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trim38Q5SZ99 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trim38Q5SZ99 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trim38Q5SZ99 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trim38Q5SZ99 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trim38Q5SZ99 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Trim38Q5SZ99 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trim38Q5SZ99 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trim38Q5SZ99 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trim38Q5SZ99 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trim38Q5SZ99 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trim38Q5SZ99 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trim38Q5SZ99 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trim38Q5SZ99 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trim38Q5SZ99 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Trim38Q5SZ99 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Trim38Q5SZ99 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trim38Q5SZ99 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trim38Q5SZ99 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trim38Q5SZ99 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trim38Q5SZ99 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trim38Q5SZ99 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trim38Q5SZ99 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trim38Q5SZ99 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trim38Q5SZ99 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trim38Q5SZ99 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trim38Q5SZ99 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trim38Q5SZ99 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trim38Q5SZ99 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trim38Q5SZ99 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trim38Q5SZ99 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trim38Q5SZ99 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trim38Q5SZ99 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Trim38Q5SZ99 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trim38Q5SZ99 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trim38Q5SZ99 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trim38Q5SZ99 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Trim38Q5SZ99 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trim38Q5SZ99 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trim38Q5SZ99 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trim38Q5SZ99 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trim38Q5SZ99 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trim38Q5SZ99 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trim38Q5SZ99 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Trim38Q5SZ99 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trim38Q5SZ99 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trim38Q5SZ99 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trim38Q5SZ99 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms