Protein–RNA interactions for Protein: Q5SX40

Myh1, Myosin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,942 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myh1Q5SX40 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Myh1Q5SX40 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Myh1Q5SX40 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Myh1Q5SX40 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Myh1Q5SX40 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Myh1Q5SX40 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Myh1Q5SX40 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Myh1Q5SX40 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Myh1Q5SX40 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Myh1Q5SX40 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Myh1Q5SX40 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Myh1Q5SX40 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Myh1Q5SX40 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Myh1Q5SX40 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Myh1Q5SX40 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Myh1Q5SX40 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Myh1Q5SX40 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Myh1Q5SX40 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Myh1Q5SX40 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Myh1Q5SX40 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Myh1Q5SX40 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Myh1Q5SX40 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Myh1Q5SX40 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Myh1Q5SX40 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Myh1Q5SX40 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Myh1Q5SX40 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Myh1Q5SX40 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Myh1Q5SX40 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Myh1Q5SX40 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Myh1Q5SX40 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Myh1Q5SX40 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Myh1Q5SX40 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Myh1Q5SX40 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Myh1Q5SX40 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Myh1Q5SX40 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Myh1Q5SX40 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Myh1Q5SX40 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Myh1Q5SX40 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Myh1Q5SX40 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Myh1Q5SX40 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Myh1Q5SX40 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Myh1Q5SX40 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Myh1Q5SX40 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Myh1Q5SX40 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Myh1Q5SX40 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Myh1Q5SX40 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Myh1Q5SX40 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Myh1Q5SX40 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Myh1Q5SX40 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Myh1Q5SX40 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Myh1Q5SX40 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Myh1Q5SX40 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Myh1Q5SX40 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Myh1Q5SX40 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Myh1Q5SX40 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Myh1Q5SX40 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Myh1Q5SX40 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Myh1Q5SX40 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Myh1Q5SX40 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Myh1Q5SX40 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Myh1Q5SX40 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Myh1Q5SX40 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Myh1Q5SX40 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Myh1Q5SX40 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Myh1Q5SX40 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Myh1Q5SX40 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Myh1Q5SX40 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Myh1Q5SX40 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Myh1Q5SX40 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Myh1Q5SX40 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Myh1Q5SX40 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Myh1Q5SX40 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Myh1Q5SX40 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Myh1Q5SX40 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Myh1Q5SX40 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Myh1Q5SX40 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Myh1Q5SX40 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Myh1Q5SX40 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Myh1Q5SX40 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Myh1Q5SX40 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Myh1Q5SX40 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Myh1Q5SX40 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Myh1Q5SX40 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Myh1Q5SX40 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Myh1Q5SX40 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Myh1Q5SX40 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Myh1Q5SX40 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Myh1Q5SX40 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Myh1Q5SX40 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Myh1Q5SX40 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Myh1Q5SX40 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Myh1Q5SX40 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Myh1Q5SX40 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Myh1Q5SX40 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Myh1Q5SX40 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Myh1Q5SX40 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Myh1Q5SX40 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Myh1Q5SX40 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Myh1Q5SX40 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Myh1Q5SX40 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms